Protein–RNA interactions for Protein: P08240

SRPRA, Signal recognition particle receptor subunit alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRPRAP08240 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SRPRAP08240 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SRPRAP08240 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SRPRAP08240 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SRPRAP08240 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SRPRAP08240 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SRPRAP08240 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SRPRAP08240 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SRPRAP08240 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SRPRAP08240 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SRPRAP08240 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SRPRAP08240 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SRPRAP08240 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SRPRAP08240 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SRPRAP08240 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SRPRAP08240 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SRPRAP08240 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SRPRAP08240 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SRPRAP08240 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SRPRAP08240 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SRPRAP08240 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SRPRAP08240 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SRPRAP08240 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SRPRAP08240 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SRPRAP08240 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SRPRAP08240 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SRPRAP08240 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SRPRAP08240 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SRPRAP08240 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SRPRAP08240 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SRPRAP08240 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SRPRAP08240 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SRPRAP08240 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SRPRAP08240 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SRPRAP08240 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SRPRAP08240 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SRPRAP08240 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SRPRAP08240 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SRPRAP08240 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SRPRAP08240 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SRPRAP08240 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SRPRAP08240 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SRPRAP08240 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SRPRAP08240 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SRPRAP08240 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SRPRAP08240 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
SRPRAP08240 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SRPRAP08240 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SRPRAP08240 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SRPRAP08240 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
SRPRAP08240 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
SRPRAP08240 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SRPRAP08240 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SRPRAP08240 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
SRPRAP08240 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SRPRAP08240 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SRPRAP08240 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SRPRAP08240 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
SRPRAP08240 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SRPRAP08240 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SRPRAP08240 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SRPRAP08240 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SRPRAP08240 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SRPRAP08240 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SRPRAP08240 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SRPRAP08240 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SRPRAP08240 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SRPRAP08240 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SRPRAP08240 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SRPRAP08240 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SRPRAP08240 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SRPRAP08240 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SRPRAP08240 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SRPRAP08240 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SRPRAP08240 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SRPRAP08240 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SRPRAP08240 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SRPRAP08240 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SRPRAP08240 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SRPRAP08240 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SRPRAP08240 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SRPRAP08240 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SRPRAP08240 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SRPRAP08240 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SRPRAP08240 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SRPRAP08240 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SRPRAP08240 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SRPRAP08240 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SRPRAP08240 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SRPRAP08240 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SRPRAP08240 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SRPRAP08240 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SRPRAP08240 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SRPRAP08240 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SRPRAP08240 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SRPRAP08240 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SRPRAP08240 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SRPRAP08240 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SRPRAP08240 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
SRPRAP08240 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms