Protein–RNA interactions for Protein: P08047

SP1, Transcription factor Sp1, humanhuman

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Length 785 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP1P08047 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SP1P08047 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SP1P08047 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SP1P08047 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SP1P08047 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SP1P08047 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SP1P08047 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SP1P08047 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SP1P08047 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SP1P08047 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
SP1P08047 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
SP1P08047 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SP1P08047 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SP1P08047 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SP1P08047 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SP1P08047 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SP1P08047 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SP1P08047 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SP1P08047 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SP1P08047 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
SP1P08047 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SP1P08047 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SP1P08047 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SP1P08047 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
SP1P08047 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SP1P08047 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SP1P08047 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SP1P08047 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SP1P08047 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
SP1P08047 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SP1P08047 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SP1P08047 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SP1P08047 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SP1P08047 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SP1P08047 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SP1P08047 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SP1P08047 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SP1P08047 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SP1P08047 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SP1P08047 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SP1P08047 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SP1P08047 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
SP1P08047 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SP1P08047 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SP1P08047 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
SP1P08047 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
SP1P08047 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SP1P08047 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SP1P08047 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SP1P08047 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SP1P08047 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SP1P08047 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SP1P08047 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SP1P08047 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SP1P08047 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SP1P08047 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SP1P08047 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SP1P08047 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SP1P08047 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
SP1P08047 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
SP1P08047 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SP1P08047 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SP1P08047 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SP1P08047 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SP1P08047 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SP1P08047 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SP1P08047 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SP1P08047 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SP1P08047 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SP1P08047 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
SP1P08047 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SP1P08047 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SP1P08047 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SP1P08047 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SP1P08047 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SP1P08047 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SP1P08047 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SP1P08047 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SP1P08047 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SP1P08047 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SP1P08047 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SP1P08047 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SP1P08047 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
SP1P08047 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SP1P08047 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SP1P08047 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SP1P08047 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SP1P08047 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SP1P08047 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
SP1P08047 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
SP1P08047 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SP1P08047 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SP1P08047 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SP1P08047 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SP1P08047 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
SP1P08047 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SP1P08047 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
SP1P08047 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SP1P08047 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SP1P08047 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
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