Protein–RNA interactions for Protein: P07195

LDHB, L-lactate dehydrogenase B chain, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LDHBP07195 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
LDHBP07195 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC28.9■■■□□ 2.22
LDHBP07195 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
LDHBP07195 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
LDHBP07195 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
LDHBP07195 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
LDHBP07195 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
LDHBP07195 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
LDHBP07195 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
LDHBP07195 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
LDHBP07195 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
LDHBP07195 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
LDHBP07195 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
LDHBP07195 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
LDHBP07195 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
LDHBP07195 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
LDHBP07195 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
LDHBP07195 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
LDHBP07195 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
LDHBP07195 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
LDHBP07195 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
LDHBP07195 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
LDHBP07195 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
LDHBP07195 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
LDHBP07195 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
LDHBP07195 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
LDHBP07195 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
LDHBP07195 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
LDHBP07195 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
LDHBP07195 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
LDHBP07195 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
LDHBP07195 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
LDHBP07195 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
LDHBP07195 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
LDHBP07195 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
LDHBP07195 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
LDHBP07195 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC28.84■■■□□ 2.21
LDHBP07195 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
LDHBP07195 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
LDHBP07195 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
LDHBP07195 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
LDHBP07195 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
LDHBP07195 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
LDHBP07195 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
LDHBP07195 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
LDHBP07195 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
LDHBP07195 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
LDHBP07195 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
LDHBP07195 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
LDHBP07195 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
LDHBP07195 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
LDHBP07195 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
LDHBP07195 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
LDHBP07195 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
LDHBP07195 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
LDHBP07195 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
LDHBP07195 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
LDHBP07195 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
LDHBP07195 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
LDHBP07195 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
LDHBP07195 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
LDHBP07195 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
LDHBP07195 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
LDHBP07195 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
LDHBP07195 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
LDHBP07195 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
LDHBP07195 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
LDHBP07195 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
LDHBP07195 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
LDHBP07195 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
LDHBP07195 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
LDHBP07195 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
LDHBP07195 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
LDHBP07195 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
LDHBP07195 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.2
LDHBP07195 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
LDHBP07195 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
LDHBP07195 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC28.75■■■□□ 2.19
LDHBP07195 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
LDHBP07195 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
LDHBP07195 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
LDHBP07195 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
LDHBP07195 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
LDHBP07195 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
LDHBP07195 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
LDHBP07195 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
LDHBP07195 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
LDHBP07195 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
LDHBP07195 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
LDHBP07195 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
LDHBP07195 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
LDHBP07195 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
LDHBP07195 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
LDHBP07195 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
LDHBP07195 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
LDHBP07195 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
LDHBP07195 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
LDHBP07195 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
LDHBP07195 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
LDHBP07195 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms