Protein–RNA interactions for Protein: P06727

APOA4, Apolipoprotein A-IV, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOA4P06727 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
APOA4P06727 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
APOA4P06727 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
APOA4P06727 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
APOA4P06727 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
APOA4P06727 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
APOA4P06727 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
APOA4P06727 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
APOA4P06727 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
APOA4P06727 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
APOA4P06727 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
APOA4P06727 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
APOA4P06727 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
APOA4P06727 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
APOA4P06727 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
APOA4P06727 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
APOA4P06727 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
APOA4P06727 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
APOA4P06727 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
APOA4P06727 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
APOA4P06727 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
APOA4P06727 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
APOA4P06727 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
APOA4P06727 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
APOA4P06727 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
APOA4P06727 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
APOA4P06727 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
APOA4P06727 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
APOA4P06727 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
APOA4P06727 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
APOA4P06727 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
APOA4P06727 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
APOA4P06727 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
APOA4P06727 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
APOA4P06727 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
APOA4P06727 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
APOA4P06727 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
APOA4P06727 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
APOA4P06727 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
APOA4P06727 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
APOA4P06727 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
APOA4P06727 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
APOA4P06727 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
APOA4P06727 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
APOA4P06727 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
APOA4P06727 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
APOA4P06727 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
APOA4P06727 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
APOA4P06727 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
APOA4P06727 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
APOA4P06727 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
APOA4P06727 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
APOA4P06727 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
APOA4P06727 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
APOA4P06727 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
APOA4P06727 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
APOA4P06727 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
APOA4P06727 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
APOA4P06727 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
APOA4P06727 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
APOA4P06727 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
APOA4P06727 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
APOA4P06727 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
APOA4P06727 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
APOA4P06727 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
APOA4P06727 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
APOA4P06727 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
APOA4P06727 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
APOA4P06727 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
APOA4P06727 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
APOA4P06727 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
APOA4P06727 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
APOA4P06727 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
APOA4P06727 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
APOA4P06727 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
APOA4P06727 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.75■■□□□ 1.39
APOA4P06727 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
APOA4P06727 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
APOA4P06727 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
APOA4P06727 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
APOA4P06727 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
APOA4P06727 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
APOA4P06727 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
APOA4P06727 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
APOA4P06727 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
APOA4P06727 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
APOA4P06727 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
APOA4P06727 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
APOA4P06727 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
APOA4P06727 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
APOA4P06727 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
APOA4P06727 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
APOA4P06727 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
APOA4P06727 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
APOA4P06727 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
APOA4P06727 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
APOA4P06727 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
APOA4P06727 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
APOA4P06727 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
APOA4P06727 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms