Protein–RNA interactions for Protein: P06028

GYPB, Glycophorin-B, humanhuman

Predictions only

Length 91 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GYPBP06028 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GYPBP06028 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
GYPBP06028 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GYPBP06028 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GYPBP06028 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GYPBP06028 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GYPBP06028 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GYPBP06028 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GYPBP06028 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GYPBP06028 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GYPBP06028 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GYPBP06028 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GYPBP06028 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GYPBP06028 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GYPBP06028 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GYPBP06028 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GYPBP06028 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GYPBP06028 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GYPBP06028 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GYPBP06028 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GYPBP06028 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GYPBP06028 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GYPBP06028 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GYPBP06028 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GYPBP06028 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GYPBP06028 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GYPBP06028 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GYPBP06028 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GYPBP06028 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
GYPBP06028 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC21.32■■□□□ 1
GYPBP06028 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GYPBP06028 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GYPBP06028 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
GYPBP06028 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GYPBP06028 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
GYPBP06028 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GYPBP06028 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GYPBP06028 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
GYPBP06028 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GYPBP06028 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GYPBP06028 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GYPBP06028 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GYPBP06028 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GYPBP06028 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC21.31■■□□□ 1
GYPBP06028 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GYPBP06028 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GYPBP06028 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GYPBP06028 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GYPBP06028 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
GYPBP06028 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
GYPBP06028 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GYPBP06028 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GYPBP06028 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
GYPBP06028 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GYPBP06028 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
GYPBP06028 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GYPBP06028 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GYPBP06028 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
GYPBP06028 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
GYPBP06028 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GYPBP06028 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
GYPBP06028 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GYPBP06028 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
GYPBP06028 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GYPBP06028 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GYPBP06028 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GYPBP06028 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC21.28■■□□□ 1
GYPBP06028 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GYPBP06028 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
GYPBP06028 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GYPBP06028 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC21.28■■□□□ 1
GYPBP06028 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
GYPBP06028 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GYPBP06028 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
GYPBP06028 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
GYPBP06028 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GYPBP06028 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
GYPBP06028 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GYPBP06028 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
GYPBP06028 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GYPBP06028 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GYPBP06028 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GYPBP06028 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GYPBP06028 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GYPBP06028 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GYPBP06028 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GYPBP06028 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GYPBP06028 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GYPBP06028 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GYPBP06028 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GYPBP06028 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GYPBP06028 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GYPBP06028 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
GYPBP06028 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GYPBP06028 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GYPBP06028 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GYPBP06028 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GYPBP06028 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GYPBP06028 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GYPBP06028 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.6 ms