Protein–RNA interactions for Protein: P01854

IGHE, Immunoglobulin heavy constant epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGHEP01854 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
IGHEP01854 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
IGHEP01854 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
IGHEP01854 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
IGHEP01854 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
IGHEP01854 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
IGHEP01854 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
IGHEP01854 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
IGHEP01854 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
IGHEP01854 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
IGHEP01854 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
IGHEP01854 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
IGHEP01854 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
IGHEP01854 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
IGHEP01854 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
IGHEP01854 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
IGHEP01854 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
IGHEP01854 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
IGHEP01854 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
IGHEP01854 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
IGHEP01854 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
IGHEP01854 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
IGHEP01854 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
IGHEP01854 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
IGHEP01854 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
IGHEP01854 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
IGHEP01854 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
IGHEP01854 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
IGHEP01854 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
IGHEP01854 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
IGHEP01854 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
IGHEP01854 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
IGHEP01854 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
IGHEP01854 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
IGHEP01854 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
IGHEP01854 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
IGHEP01854 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
IGHEP01854 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
IGHEP01854 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
IGHEP01854 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
IGHEP01854 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
IGHEP01854 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
IGHEP01854 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
IGHEP01854 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
IGHEP01854 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
IGHEP01854 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
IGHEP01854 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
IGHEP01854 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
IGHEP01854 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
IGHEP01854 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
IGHEP01854 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
IGHEP01854 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
IGHEP01854 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
IGHEP01854 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
IGHEP01854 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
IGHEP01854 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
IGHEP01854 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
IGHEP01854 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
IGHEP01854 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
IGHEP01854 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
IGHEP01854 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
IGHEP01854 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
IGHEP01854 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
IGHEP01854 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
IGHEP01854 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
IGHEP01854 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
IGHEP01854 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
IGHEP01854 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
IGHEP01854 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
IGHEP01854 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
IGHEP01854 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
IGHEP01854 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
IGHEP01854 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
IGHEP01854 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
IGHEP01854 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
IGHEP01854 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
IGHEP01854 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
IGHEP01854 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
IGHEP01854 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
IGHEP01854 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
IGHEP01854 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
IGHEP01854 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
IGHEP01854 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
IGHEP01854 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
IGHEP01854 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
IGHEP01854 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
IGHEP01854 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
IGHEP01854 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
IGHEP01854 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
IGHEP01854 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
IGHEP01854 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
IGHEP01854 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
IGHEP01854 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
IGHEP01854 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
IGHEP01854 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
IGHEP01854 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
IGHEP01854 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
IGHEP01854 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
IGHEP01854 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
IGHEP01854 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.5 ms