Protein–RNA interactions for Protein: P01733

TRBV12-3, T-cell receptor beta chain V region YT35, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV12-3P01733 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRBV12-3P01733 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRBV12-3P01733 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRBV12-3P01733 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRBV12-3P01733 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRBV12-3P01733 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRBV12-3P01733 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
TRBV12-3P01733 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRBV12-3P01733 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRBV12-3P01733 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRBV12-3P01733 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRBV12-3P01733 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRBV12-3P01733 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
TRBV12-3P01733 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRBV12-3P01733 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRBV12-3P01733 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRBV12-3P01733 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRBV12-3P01733 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRBV12-3P01733 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRBV12-3P01733 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
TRBV12-3P01733 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
TRBV12-3P01733 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRBV12-3P01733 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRBV12-3P01733 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRBV12-3P01733 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRBV12-3P01733 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
TRBV12-3P01733 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRBV12-3P01733 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRBV12-3P01733 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRBV12-3P01733 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRBV12-3P01733 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRBV12-3P01733 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRBV12-3P01733 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRBV12-3P01733 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRBV12-3P01733 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRBV12-3P01733 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRBV12-3P01733 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRBV12-3P01733 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRBV12-3P01733 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRBV12-3P01733 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRBV12-3P01733 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRBV12-3P01733 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRBV12-3P01733 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRBV12-3P01733 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRBV12-3P01733 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRBV12-3P01733 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRBV12-3P01733 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRBV12-3P01733 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRBV12-3P01733 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRBV12-3P01733 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRBV12-3P01733 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRBV12-3P01733 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRBV12-3P01733 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRBV12-3P01733 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRBV12-3P01733 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRBV12-3P01733 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRBV12-3P01733 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRBV12-3P01733 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRBV12-3P01733 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
TRBV12-3P01733 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRBV12-3P01733 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRBV12-3P01733 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRBV12-3P01733 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRBV12-3P01733 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRBV12-3P01733 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
TRBV12-3P01733 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRBV12-3P01733 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRBV12-3P01733 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRBV12-3P01733 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRBV12-3P01733 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRBV12-3P01733 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRBV12-3P01733 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRBV12-3P01733 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRBV12-3P01733 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRBV12-3P01733 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRBV12-3P01733 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRBV12-3P01733 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRBV12-3P01733 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRBV12-3P01733 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRBV12-3P01733 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRBV12-3P01733 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRBV12-3P01733 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRBV12-3P01733 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
TRBV12-3P01733 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
TRBV12-3P01733 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRBV12-3P01733 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRBV12-3P01733 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRBV12-3P01733 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRBV12-3P01733 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRBV12-3P01733 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRBV12-3P01733 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRBV12-3P01733 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRBV12-3P01733 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRBV12-3P01733 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRBV12-3P01733 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRBV12-3P01733 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRBV12-3P01733 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
TRBV12-3P01733 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRBV12-3P01733 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
TRBV12-3P01733 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 591.4 ms