Protein–RNA interactions for Protein: P01011

SERPINA3, Alpha-1-antichymotrypsin, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERPINA3P01011 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SERPINA3P01011 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SERPINA3P01011 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SERPINA3P01011 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SERPINA3P01011 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SERPINA3P01011 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SERPINA3P01011 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SERPINA3P01011 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SERPINA3P01011 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SERPINA3P01011 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SERPINA3P01011 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SERPINA3P01011 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SERPINA3P01011 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SERPINA3P01011 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SERPINA3P01011 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SERPINA3P01011 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SERPINA3P01011 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SERPINA3P01011 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SERPINA3P01011 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SERPINA3P01011 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SERPINA3P01011 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SERPINA3P01011 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
SERPINA3P01011 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SERPINA3P01011 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SERPINA3P01011 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SERPINA3P01011 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SERPINA3P01011 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SERPINA3P01011 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SERPINA3P01011 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SERPINA3P01011 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SERPINA3P01011 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SERPINA3P01011 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SERPINA3P01011 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SERPINA3P01011 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SERPINA3P01011 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SERPINA3P01011 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SERPINA3P01011 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SERPINA3P01011 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SERPINA3P01011 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SERPINA3P01011 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SERPINA3P01011 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SERPINA3P01011 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SERPINA3P01011 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SERPINA3P01011 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SERPINA3P01011 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SERPINA3P01011 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SERPINA3P01011 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SERPINA3P01011 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SERPINA3P01011 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SERPINA3P01011 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
SERPINA3P01011 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SERPINA3P01011 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SERPINA3P01011 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SERPINA3P01011 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SERPINA3P01011 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SERPINA3P01011 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SERPINA3P01011 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SERPINA3P01011 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SERPINA3P01011 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SERPINA3P01011 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SERPINA3P01011 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SERPINA3P01011 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SERPINA3P01011 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SERPINA3P01011 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SERPINA3P01011 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SERPINA3P01011 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SERPINA3P01011 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SERPINA3P01011 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SERPINA3P01011 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
SERPINA3P01011 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SERPINA3P01011 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC21■□□□□ 0.95
SERPINA3P01011 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
SERPINA3P01011 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SERPINA3P01011 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SERPINA3P01011 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
SERPINA3P01011 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
SERPINA3P01011 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SERPINA3P01011 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SERPINA3P01011 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SERPINA3P01011 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SERPINA3P01011 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SERPINA3P01011 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SERPINA3P01011 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SERPINA3P01011 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SERPINA3P01011 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SERPINA3P01011 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SERPINA3P01011 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SERPINA3P01011 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SERPINA3P01011 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SERPINA3P01011 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SERPINA3P01011 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SERPINA3P01011 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SERPINA3P01011 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SERPINA3P01011 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SERPINA3P01011 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
SERPINA3P01011 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
SERPINA3P01011 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SERPINA3P01011 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SERPINA3P01011 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SERPINA3P01011 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms