Protein–RNA interactions for Protein: P00738

HP, Haptoglobin, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPP00738 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HPP00738 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HPP00738 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HPP00738 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HPP00738 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HPP00738 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HPP00738 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HPP00738 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HPP00738 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HPP00738 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HPP00738 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HPP00738 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HPP00738 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HPP00738 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HPP00738 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HPP00738 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HPP00738 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HPP00738 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HPP00738 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HPP00738 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HPP00738 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HPP00738 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HPP00738 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HPP00738 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HPP00738 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HPP00738 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HPP00738 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HPP00738 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HPP00738 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HPP00738 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HPP00738 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HPP00738 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HPP00738 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HPP00738 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HPP00738 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HPP00738 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HPP00738 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
HPP00738 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HPP00738 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HPP00738 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HPP00738 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HPP00738 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HPP00738 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HPP00738 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HPP00738 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HPP00738 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HPP00738 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HPP00738 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HPP00738 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HPP00738 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HPP00738 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HPP00738 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
HPP00738 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HPP00738 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HPP00738 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HPP00738 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
HPP00738 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
HPP00738 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HPP00738 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
HPP00738 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HPP00738 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HPP00738 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HPP00738 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HPP00738 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HPP00738 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HPP00738 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HPP00738 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HPP00738 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
HPP00738 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HPP00738 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HPP00738 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HPP00738 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HPP00738 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HPP00738 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HPP00738 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
HPP00738 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HPP00738 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
HPP00738 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
HPP00738 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HPP00738 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HPP00738 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HPP00738 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HPP00738 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HPP00738 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HPP00738 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HPP00738 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HPP00738 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HPP00738 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HPP00738 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HPP00738 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HPP00738 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HPP00738 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HPP00738 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HPP00738 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HPP00738 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HPP00738 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HPP00738 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HPP00738 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
HPP00738 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
HPP00738 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms