Protein–RNA interactions for Protein: P00488

F13A1, Coagulation factor XIII A chain, humanhuman

Predictions only

Length 732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F13A1P00488 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
F13A1P00488 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
F13A1P00488 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
F13A1P00488 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
F13A1P00488 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
F13A1P00488 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
F13A1P00488 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
F13A1P00488 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
F13A1P00488 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
F13A1P00488 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
F13A1P00488 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
F13A1P00488 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
F13A1P00488 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
F13A1P00488 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
F13A1P00488 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
F13A1P00488 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
F13A1P00488 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
F13A1P00488 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
F13A1P00488 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
F13A1P00488 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
F13A1P00488 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
F13A1P00488 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
F13A1P00488 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
F13A1P00488 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
F13A1P00488 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
F13A1P00488 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
F13A1P00488 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
F13A1P00488 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
F13A1P00488 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
F13A1P00488 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
F13A1P00488 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
F13A1P00488 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
F13A1P00488 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
F13A1P00488 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
F13A1P00488 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
F13A1P00488 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
F13A1P00488 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
F13A1P00488 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
F13A1P00488 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
F13A1P00488 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
F13A1P00488 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
F13A1P00488 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
F13A1P00488 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
F13A1P00488 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
F13A1P00488 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
F13A1P00488 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
F13A1P00488 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
F13A1P00488 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
F13A1P00488 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
F13A1P00488 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
F13A1P00488 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
F13A1P00488 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
F13A1P00488 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
F13A1P00488 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
F13A1P00488 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
F13A1P00488 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
F13A1P00488 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
F13A1P00488 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
F13A1P00488 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
F13A1P00488 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
F13A1P00488 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
F13A1P00488 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
F13A1P00488 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
F13A1P00488 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
F13A1P00488 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
F13A1P00488 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
F13A1P00488 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
F13A1P00488 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
F13A1P00488 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
F13A1P00488 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
F13A1P00488 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
F13A1P00488 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
F13A1P00488 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
F13A1P00488 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
F13A1P00488 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
F13A1P00488 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
F13A1P00488 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
F13A1P00488 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
F13A1P00488 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
F13A1P00488 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
F13A1P00488 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
F13A1P00488 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
F13A1P00488 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
F13A1P00488 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC27.54■■■□□ 2
F13A1P00488 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
F13A1P00488 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
F13A1P00488 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
F13A1P00488 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
F13A1P00488 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
F13A1P00488 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
F13A1P00488 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
F13A1P00488 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
F13A1P00488 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC27.52■■■□□ 2
F13A1P00488 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
F13A1P00488 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
F13A1P00488 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
F13A1P00488 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
F13A1P00488 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
F13A1P00488 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
F13A1P00488 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms