Protein–RNA interactions for Protein: O95931

CBX7, Chromobox protein homolog 7, humanhuman

Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX7O95931 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CBX7O95931 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CBX7O95931 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CBX7O95931 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CBX7O95931 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CBX7O95931 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CBX7O95931 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CBX7O95931 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CBX7O95931 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CBX7O95931 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CBX7O95931 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CBX7O95931 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CBX7O95931 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CBX7O95931 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CBX7O95931 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CBX7O95931 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CBX7O95931 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CBX7O95931 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CBX7O95931 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CBX7O95931 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CBX7O95931 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CBX7O95931 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CBX7O95931 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CBX7O95931 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CBX7O95931 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CBX7O95931 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CBX7O95931 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CBX7O95931 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CBX7O95931 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CBX7O95931 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CBX7O95931 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CBX7O95931 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CBX7O95931 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CBX7O95931 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CBX7O95931 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CBX7O95931 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CBX7O95931 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CBX7O95931 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CBX7O95931 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CBX7O95931 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CBX7O95931 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CBX7O95931 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CBX7O95931 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CBX7O95931 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CBX7O95931 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CBX7O95931 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CBX7O95931 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CBX7O95931 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CBX7O95931 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CBX7O95931 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CBX7O95931 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CBX7O95931 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CBX7O95931 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CBX7O95931 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CBX7O95931 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CBX7O95931 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CBX7O95931 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CBX7O95931 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CBX7O95931 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CBX7O95931 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CBX7O95931 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CBX7O95931 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CBX7O95931 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CBX7O95931 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CBX7O95931 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CBX7O95931 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CBX7O95931 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
CBX7O95931 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CBX7O95931 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CBX7O95931 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CBX7O95931 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CBX7O95931 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CBX7O95931 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CBX7O95931 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CBX7O95931 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CBX7O95931 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CBX7O95931 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CBX7O95931 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CBX7O95931 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CBX7O95931 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CBX7O95931 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CBX7O95931 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CBX7O95931 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CBX7O95931 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CBX7O95931 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CBX7O95931 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CBX7O95931 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CBX7O95931 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CBX7O95931 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CBX7O95931 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CBX7O95931 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CBX7O95931 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CBX7O95931 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CBX7O95931 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CBX7O95931 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CBX7O95931 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CBX7O95931 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CBX7O95931 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CBX7O95931 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CBX7O95931 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 154.6 ms