Protein–RNA interactions for Protein: O95786

DDX58, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX58, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX58O95786 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC30.38■■■□□ 2.45
DDX58O95786 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
DDX58O95786 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC30.38■■■□□ 2.45
DDX58O95786 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
DDX58O95786 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
DDX58O95786 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
DDX58O95786 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
DDX58O95786 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
DDX58O95786 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
DDX58O95786 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
DDX58O95786 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
DDX58O95786 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
DDX58O95786 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
DDX58O95786 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
DDX58O95786 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
DDX58O95786 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
DDX58O95786 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
DDX58O95786 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC30.36■■■□□ 2.45
DDX58O95786 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC30.36■■■□□ 2.45
DDX58O95786 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
DDX58O95786 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
DDX58O95786 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC30.35■■■□□ 2.45
DDX58O95786 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC30.35■■■□□ 2.45
DDX58O95786 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
DDX58O95786 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
DDX58O95786 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
DDX58O95786 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
DDX58O95786 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
DDX58O95786 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
DDX58O95786 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
DDX58O95786 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC30.34■■■□□ 2.45
DDX58O95786 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
DDX58O95786 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
DDX58O95786 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
DDX58O95786 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
DDX58O95786 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
DDX58O95786 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC30.33■■■□□ 2.45
DDX58O95786 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
DDX58O95786 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.45
DDX58O95786 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
DDX58O95786 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC30.32■■■□□ 2.44
DDX58O95786 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC30.32■■■□□ 2.44
DDX58O95786 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
DDX58O95786 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.32■■■□□ 2.44
DDX58O95786 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
DDX58O95786 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC30.32■■■□□ 2.44
DDX58O95786 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
DDX58O95786 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.31■■■□□ 2.44
DDX58O95786 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC30.31■■■□□ 2.44
DDX58O95786 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC30.31■■■□□ 2.44
DDX58O95786 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
DDX58O95786 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
DDX58O95786 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
DDX58O95786 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
DDX58O95786 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
DDX58O95786 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
DDX58O95786 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
DDX58O95786 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC30.29■■■□□ 2.44
DDX58O95786 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
DDX58O95786 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC30.28■■■□□ 2.44
DDX58O95786 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
DDX58O95786 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
DDX58O95786 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC30.27■■■□□ 2.44
DDX58O95786 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
DDX58O95786 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC30.27■■■□□ 2.44
DDX58O95786 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
DDX58O95786 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC30.26■■■□□ 2.43
DDX58O95786 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
DDX58O95786 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC30.26■■■□□ 2.43
DDX58O95786 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
DDX58O95786 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC30.25■■■□□ 2.43
DDX58O95786 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
DDX58O95786 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
DDX58O95786 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC30.25■■■□□ 2.43
DDX58O95786 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
DDX58O95786 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
DDX58O95786 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
DDX58O95786 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
DDX58O95786 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC30.24■■■□□ 2.43
DDX58O95786 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
DDX58O95786 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
DDX58O95786 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
DDX58O95786 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
DDX58O95786 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
DDX58O95786 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
DDX58O95786 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
DDX58O95786 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
DDX58O95786 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
DDX58O95786 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
DDX58O95786 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
DDX58O95786 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
DDX58O95786 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC30.21■■■□□ 2.43
DDX58O95786 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
DDX58O95786 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
DDX58O95786 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
DDX58O95786 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC30.21■■■□□ 2.43
DDX58O95786 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
DDX58O95786 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
DDX58O95786 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
DDX58O95786 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms