Protein–RNA interactions for Protein: O95754

SEMA4F, Semaphorin-4F, humanhuman

Predictions only

Length 770 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4FO95754 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SEMA4FO95754 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SEMA4FO95754 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
SEMA4FO95754 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SEMA4FO95754 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SEMA4FO95754 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SEMA4FO95754 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SEMA4FO95754 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SEMA4FO95754 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
SEMA4FO95754 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
SEMA4FO95754 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SEMA4FO95754 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SEMA4FO95754 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SEMA4FO95754 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SEMA4FO95754 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
SEMA4FO95754 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SEMA4FO95754 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SEMA4FO95754 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SEMA4FO95754 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SEMA4FO95754 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SEMA4FO95754 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SEMA4FO95754 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SEMA4FO95754 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SEMA4FO95754 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SEMA4FO95754 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SEMA4FO95754 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SEMA4FO95754 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SEMA4FO95754 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SEMA4FO95754 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SEMA4FO95754 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SEMA4FO95754 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SEMA4FO95754 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SEMA4FO95754 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SEMA4FO95754 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SEMA4FO95754 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SEMA4FO95754 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SEMA4FO95754 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SEMA4FO95754 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SEMA4FO95754 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SEMA4FO95754 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SEMA4FO95754 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SEMA4FO95754 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SEMA4FO95754 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SEMA4FO95754 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SEMA4FO95754 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
SEMA4FO95754 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SEMA4FO95754 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SEMA4FO95754 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SEMA4FO95754 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SEMA4FO95754 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SEMA4FO95754 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SEMA4FO95754 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SEMA4FO95754 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SEMA4FO95754 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SEMA4FO95754 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SEMA4FO95754 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SEMA4FO95754 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SEMA4FO95754 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SEMA4FO95754 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SEMA4FO95754 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SEMA4FO95754 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SEMA4FO95754 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SEMA4FO95754 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SEMA4FO95754 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SEMA4FO95754 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SEMA4FO95754 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SEMA4FO95754 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
SEMA4FO95754 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SEMA4FO95754 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SEMA4FO95754 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SEMA4FO95754 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SEMA4FO95754 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SEMA4FO95754 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SEMA4FO95754 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SEMA4FO95754 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SEMA4FO95754 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SEMA4FO95754 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SEMA4FO95754 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
SEMA4FO95754 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SEMA4FO95754 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SEMA4FO95754 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SEMA4FO95754 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SEMA4FO95754 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SEMA4FO95754 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
SEMA4FO95754 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SEMA4FO95754 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
SEMA4FO95754 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SEMA4FO95754 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SEMA4FO95754 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SEMA4FO95754 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
SEMA4FO95754 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
SEMA4FO95754 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SEMA4FO95754 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SEMA4FO95754 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SEMA4FO95754 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SEMA4FO95754 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SEMA4FO95754 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SEMA4FO95754 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
SEMA4FO95754 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SEMA4FO95754 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms