Protein–RNA interactions for Protein: O95602

POLR1A, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1AO95602 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC35.25■■■■□ 3.23
POLR1AO95602 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC35.25■■■■□ 3.23
POLR1AO95602 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC35.25■■■■□ 3.23
POLR1AO95602 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.25■■■■□ 3.23
POLR1AO95602 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
POLR1AO95602 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC35.24■■■■□ 3.23
POLR1AO95602 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC35.24■■■■□ 3.23
POLR1AO95602 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC35.24■■■■□ 3.23
POLR1AO95602 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC35.24■■■■□ 3.23
POLR1AO95602 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC35.23■■■■□ 3.23
POLR1AO95602 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC35.23■■■■□ 3.23
POLR1AO95602 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
POLR1AO95602 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
POLR1AO95602 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC35.22■■■■□ 3.23
POLR1AO95602 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
POLR1AO95602 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC35.21■■■■□ 3.23
POLR1AO95602 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
POLR1AO95602 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC35.21■■■■□ 3.23
POLR1AO95602 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
POLR1AO95602 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC35.2■■■■□ 3.23
POLR1AO95602 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
POLR1AO95602 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
POLR1AO95602 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.2■■■■□ 3.23
POLR1AO95602 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
POLR1AO95602 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC35.19■■■■□ 3.22
POLR1AO95602 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC35.19■■■■□ 3.22
POLR1AO95602 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC35.18■■■■□ 3.22
POLR1AO95602 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC35.18■■■■□ 3.22
POLR1AO95602 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
POLR1AO95602 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC35.18■■■■□ 3.22
POLR1AO95602 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC35.18■■■■□ 3.22
POLR1AO95602 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
POLR1AO95602 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC35.17■■■■□ 3.22
POLR1AO95602 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC35.17■■■■□ 3.22
POLR1AO95602 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
POLR1AO95602 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC35.16■■■■□ 3.22
POLR1AO95602 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
POLR1AO95602 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC35.15■■■■□ 3.22
POLR1AO95602 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC35.15■■■■□ 3.22
POLR1AO95602 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC35.15■■■■□ 3.22
POLR1AO95602 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.15■■■■□ 3.22
POLR1AO95602 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
POLR1AO95602 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
POLR1AO95602 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
POLR1AO95602 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC35.15■■■■□ 3.22
POLR1AO95602 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
POLR1AO95602 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC35.14■■■■□ 3.22
POLR1AO95602 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC35.14■■■■□ 3.22
POLR1AO95602 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC35.13■■■■□ 3.21
POLR1AO95602 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC35.13■■■■□ 3.21
POLR1AO95602 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
POLR1AO95602 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC35.12■■■■□ 3.21
POLR1AO95602 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.12■■■■□ 3.21
POLR1AO95602 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
POLR1AO95602 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
POLR1AO95602 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC35.12■■■■□ 3.21
POLR1AO95602 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
POLR1AO95602 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC35.12■■■■□ 3.21
POLR1AO95602 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC35.11■■■■□ 3.21
POLR1AO95602 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
POLR1AO95602 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC35.1■■■■□ 3.21
POLR1AO95602 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC35.1■■■■□ 3.21
POLR1AO95602 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC35.1■■■■□ 3.21
POLR1AO95602 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.1■■■■□ 3.21
POLR1AO95602 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
POLR1AO95602 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
POLR1AO95602 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
POLR1AO95602 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
POLR1AO95602 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
POLR1AO95602 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC35.08■■■■□ 3.21
POLR1AO95602 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
POLR1AO95602 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
POLR1AO95602 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
POLR1AO95602 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC35.07■■■■□ 3.2
POLR1AO95602 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC35.07■■■■□ 3.2
POLR1AO95602 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC35.07■■■■□ 3.2
POLR1AO95602 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC35.06■■■■□ 3.2
POLR1AO95602 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC35.06■■■■□ 3.2
POLR1AO95602 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
POLR1AO95602 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC35.06■■■■□ 3.2
POLR1AO95602 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC35.06■■■■□ 3.2
POLR1AO95602 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
POLR1AO95602 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
POLR1AO95602 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC35.05■■■■□ 3.2
POLR1AO95602 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
POLR1AO95602 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC35.04■■■■□ 3.2
POLR1AO95602 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
POLR1AO95602 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
POLR1AO95602 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC35.03■■■■□ 3.2
POLR1AO95602 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC35.03■■■■□ 3.2
POLR1AO95602 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC35.03■■■■□ 3.2
POLR1AO95602 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC35.03■■■■□ 3.2
POLR1AO95602 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC35.03■■■■□ 3.2
POLR1AO95602 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.02■■■■□ 3.2
POLR1AO95602 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC35.02■■■■□ 3.2
POLR1AO95602 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
POLR1AO95602 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
POLR1AO95602 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC35.02■■■■□ 3.2
POLR1AO95602 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC35.02■■■■□ 3.2
POLR1AO95602 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC35.02■■■■□ 3.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms