Protein–RNA interactions for Protein: O95551

TDP2, Tyrosyl-DNA phosphodiesterase 2, humanhuman

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDP2O95551 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TDP2O95551 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TDP2O95551 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TDP2O95551 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TDP2O95551 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TDP2O95551 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TDP2O95551 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TDP2O95551 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
TDP2O95551 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TDP2O95551 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
TDP2O95551 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
TDP2O95551 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TDP2O95551 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
TDP2O95551 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
TDP2O95551 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
TDP2O95551 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TDP2O95551 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TDP2O95551 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
TDP2O95551 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
TDP2O95551 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
TDP2O95551 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TDP2O95551 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TDP2O95551 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TDP2O95551 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TDP2O95551 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
TDP2O95551 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TDP2O95551 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TDP2O95551 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TDP2O95551 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TDP2O95551 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TDP2O95551 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TDP2O95551 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TDP2O95551 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TDP2O95551 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
TDP2O95551 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TDP2O95551 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
TDP2O95551 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TDP2O95551 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TDP2O95551 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TDP2O95551 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TDP2O95551 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TDP2O95551 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
TDP2O95551 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
TDP2O95551 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
TDP2O95551 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
TDP2O95551 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TDP2O95551 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TDP2O95551 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TDP2O95551 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
TDP2O95551 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TDP2O95551 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TDP2O95551 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TDP2O95551 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TDP2O95551 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
TDP2O95551 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TDP2O95551 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TDP2O95551 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TDP2O95551 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TDP2O95551 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TDP2O95551 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
TDP2O95551 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TDP2O95551 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TDP2O95551 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TDP2O95551 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
TDP2O95551 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TDP2O95551 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TDP2O95551 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TDP2O95551 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TDP2O95551 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TDP2O95551 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TDP2O95551 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TDP2O95551 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
TDP2O95551 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TDP2O95551 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TDP2O95551 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TDP2O95551 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TDP2O95551 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TDP2O95551 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TDP2O95551 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
TDP2O95551 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TDP2O95551 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TDP2O95551 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
TDP2O95551 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TDP2O95551 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TDP2O95551 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
TDP2O95551 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TDP2O95551 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TDP2O95551 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TDP2O95551 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TDP2O95551 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TDP2O95551 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TDP2O95551 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TDP2O95551 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TDP2O95551 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TDP2O95551 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TDP2O95551 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TDP2O95551 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TDP2O95551 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TDP2O95551 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TDP2O95551 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms