Protein–RNA interactions for Protein: O95260

ATE1, Arginyl-tRNA--protein transferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATE1O95260 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATE1O95260 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATE1O95260 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATE1O95260 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
ATE1O95260 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATE1O95260 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATE1O95260 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATE1O95260 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATE1O95260 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATE1O95260 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATE1O95260 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATE1O95260 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATE1O95260 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATE1O95260 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATE1O95260 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATE1O95260 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATE1O95260 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATE1O95260 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATE1O95260 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATE1O95260 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATE1O95260 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATE1O95260 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATE1O95260 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATE1O95260 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATE1O95260 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATE1O95260 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATE1O95260 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
ATE1O95260 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATE1O95260 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATE1O95260 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATE1O95260 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATE1O95260 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATE1O95260 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATE1O95260 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATE1O95260 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATE1O95260 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
ATE1O95260 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATE1O95260 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATE1O95260 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATE1O95260 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATE1O95260 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
ATE1O95260 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATE1O95260 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATE1O95260 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATE1O95260 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATE1O95260 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATE1O95260 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATE1O95260 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATE1O95260 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATE1O95260 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATE1O95260 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ATE1O95260 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ATE1O95260 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ATE1O95260 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ATE1O95260 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATE1O95260 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATE1O95260 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATE1O95260 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATE1O95260 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATE1O95260 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATE1O95260 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATE1O95260 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
ATE1O95260 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATE1O95260 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATE1O95260 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATE1O95260 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATE1O95260 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATE1O95260 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATE1O95260 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATE1O95260 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATE1O95260 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATE1O95260 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATE1O95260 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATE1O95260 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATE1O95260 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATE1O95260 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATE1O95260 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATE1O95260 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATE1O95260 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATE1O95260 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATE1O95260 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATE1O95260 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATE1O95260 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATE1O95260 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATE1O95260 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATE1O95260 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATE1O95260 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATE1O95260 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
ATE1O95260 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATE1O95260 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATE1O95260 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATE1O95260 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATE1O95260 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATE1O95260 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATE1O95260 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATE1O95260 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATE1O95260 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATE1O95260 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATE1O95260 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATE1O95260 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms