Protein–RNA interactions for Protein: O95219

SNX4, Sorting nexin-4, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX4O95219 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SNX4O95219 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SNX4O95219 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SNX4O95219 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SNX4O95219 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SNX4O95219 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SNX4O95219 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SNX4O95219 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SNX4O95219 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SNX4O95219 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SNX4O95219 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SNX4O95219 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SNX4O95219 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SNX4O95219 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SNX4O95219 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SNX4O95219 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SNX4O95219 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SNX4O95219 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SNX4O95219 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SNX4O95219 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SNX4O95219 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SNX4O95219 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SNX4O95219 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SNX4O95219 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SNX4O95219 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SNX4O95219 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SNX4O95219 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SNX4O95219 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SNX4O95219 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SNX4O95219 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SNX4O95219 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SNX4O95219 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SNX4O95219 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SNX4O95219 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SNX4O95219 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SNX4O95219 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SNX4O95219 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SNX4O95219 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SNX4O95219 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SNX4O95219 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SNX4O95219 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SNX4O95219 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SNX4O95219 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SNX4O95219 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SNX4O95219 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SNX4O95219 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SNX4O95219 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SNX4O95219 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SNX4O95219 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SNX4O95219 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SNX4O95219 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SNX4O95219 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SNX4O95219 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SNX4O95219 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SNX4O95219 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SNX4O95219 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SNX4O95219 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SNX4O95219 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SNX4O95219 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SNX4O95219 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SNX4O95219 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SNX4O95219 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SNX4O95219 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SNX4O95219 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SNX4O95219 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SNX4O95219 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SNX4O95219 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SNX4O95219 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SNX4O95219 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SNX4O95219 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SNX4O95219 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SNX4O95219 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SNX4O95219 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SNX4O95219 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SNX4O95219 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SNX4O95219 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SNX4O95219 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SNX4O95219 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SNX4O95219 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SNX4O95219 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SNX4O95219 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SNX4O95219 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SNX4O95219 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SNX4O95219 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SNX4O95219 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SNX4O95219 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SNX4O95219 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SNX4O95219 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNX4O95219 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNX4O95219 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNX4O95219 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNX4O95219 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNX4O95219 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNX4O95219 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNX4O95219 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SNX4O95219 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNX4O95219 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SNX4O95219 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SNX4O95219 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SNX4O95219 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms