Protein–RNA interactions for Protein: O94985

CLSTN1, Calsyntenin-1, humanhuman

Predictions only

Length 981 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSTN1O94985 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CLSTN1O94985 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CLSTN1O94985 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CLSTN1O94985 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CLSTN1O94985 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CLSTN1O94985 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CLSTN1O94985 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CLSTN1O94985 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CLSTN1O94985 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
CLSTN1O94985 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CLSTN1O94985 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
CLSTN1O94985 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CLSTN1O94985 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CLSTN1O94985 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CLSTN1O94985 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CLSTN1O94985 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CLSTN1O94985 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CLSTN1O94985 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CLSTN1O94985 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CLSTN1O94985 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CLSTN1O94985 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CLSTN1O94985 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CLSTN1O94985 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CLSTN1O94985 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CLSTN1O94985 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CLSTN1O94985 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CLSTN1O94985 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CLSTN1O94985 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CLSTN1O94985 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CLSTN1O94985 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CLSTN1O94985 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
CLSTN1O94985 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CLSTN1O94985 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CLSTN1O94985 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CLSTN1O94985 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CLSTN1O94985 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CLSTN1O94985 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CLSTN1O94985 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CLSTN1O94985 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CLSTN1O94985 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
CLSTN1O94985 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CLSTN1O94985 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CLSTN1O94985 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CLSTN1O94985 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
CLSTN1O94985 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CLSTN1O94985 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CLSTN1O94985 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CLSTN1O94985 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CLSTN1O94985 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
CLSTN1O94985 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CLSTN1O94985 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CLSTN1O94985 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CLSTN1O94985 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CLSTN1O94985 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CLSTN1O94985 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CLSTN1O94985 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CLSTN1O94985 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CLSTN1O94985 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CLSTN1O94985 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CLSTN1O94985 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
CLSTN1O94985 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CLSTN1O94985 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CLSTN1O94985 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CLSTN1O94985 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CLSTN1O94985 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CLSTN1O94985 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CLSTN1O94985 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CLSTN1O94985 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CLSTN1O94985 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CLSTN1O94985 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CLSTN1O94985 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CLSTN1O94985 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CLSTN1O94985 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CLSTN1O94985 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CLSTN1O94985 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CLSTN1O94985 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CLSTN1O94985 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CLSTN1O94985 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CLSTN1O94985 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CLSTN1O94985 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CLSTN1O94985 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CLSTN1O94985 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CLSTN1O94985 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CLSTN1O94985 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
CLSTN1O94985 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CLSTN1O94985 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
CLSTN1O94985 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CLSTN1O94985 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CLSTN1O94985 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CLSTN1O94985 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CLSTN1O94985 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CLSTN1O94985 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
CLSTN1O94985 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CLSTN1O94985 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CLSTN1O94985 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CLSTN1O94985 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CLSTN1O94985 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
CLSTN1O94985 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CLSTN1O94985 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CLSTN1O94985 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.2 ms