Protein–RNA interactions for Protein: O94886

TMEM63A, CSC1-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 807 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM63AO94886 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TMEM63AO94886 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TMEM63AO94886 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
TMEM63AO94886 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TMEM63AO94886 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TMEM63AO94886 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TMEM63AO94886 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TMEM63AO94886 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TMEM63AO94886 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TMEM63AO94886 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TMEM63AO94886 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
TMEM63AO94886 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TMEM63AO94886 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TMEM63AO94886 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TMEM63AO94886 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TMEM63AO94886 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TMEM63AO94886 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TMEM63AO94886 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TMEM63AO94886 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TMEM63AO94886 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TMEM63AO94886 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TMEM63AO94886 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TMEM63AO94886 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TMEM63AO94886 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TMEM63AO94886 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TMEM63AO94886 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TMEM63AO94886 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TMEM63AO94886 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TMEM63AO94886 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TMEM63AO94886 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TMEM63AO94886 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TMEM63AO94886 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TMEM63AO94886 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TMEM63AO94886 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TMEM63AO94886 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TMEM63AO94886 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TMEM63AO94886 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMEM63AO94886 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMEM63AO94886 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMEM63AO94886 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMEM63AO94886 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMEM63AO94886 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMEM63AO94886 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMEM63AO94886 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMEM63AO94886 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMEM63AO94886 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMEM63AO94886 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMEM63AO94886 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMEM63AO94886 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMEM63AO94886 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TMEM63AO94886 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TMEM63AO94886 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TMEM63AO94886 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
TMEM63AO94886 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TMEM63AO94886 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TMEM63AO94886 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TMEM63AO94886 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TMEM63AO94886 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TMEM63AO94886 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TMEM63AO94886 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TMEM63AO94886 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TMEM63AO94886 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TMEM63AO94886 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TMEM63AO94886 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TMEM63AO94886 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TMEM63AO94886 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TMEM63AO94886 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TMEM63AO94886 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TMEM63AO94886 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TMEM63AO94886 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TMEM63AO94886 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TMEM63AO94886 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TMEM63AO94886 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TMEM63AO94886 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TMEM63AO94886 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TMEM63AO94886 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TMEM63AO94886 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
TMEM63AO94886 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TMEM63AO94886 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TMEM63AO94886 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TMEM63AO94886 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TMEM63AO94886 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TMEM63AO94886 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TMEM63AO94886 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TMEM63AO94886 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TMEM63AO94886 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TMEM63AO94886 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TMEM63AO94886 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TMEM63AO94886 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TMEM63AO94886 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TMEM63AO94886 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
TMEM63AO94886 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TMEM63AO94886 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TMEM63AO94886 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TMEM63AO94886 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TMEM63AO94886 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TMEM63AO94886 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TMEM63AO94886 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
TMEM63AO94886 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TMEM63AO94886 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.9 ms