Protein–RNA interactions for Protein: O94806

PRKD3, Serine/threonine-protein kinase D3, humanhuman

Predictions only

Length 890 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKD3O94806 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRKD3O94806 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRKD3O94806 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRKD3O94806 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRKD3O94806 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRKD3O94806 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRKD3O94806 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRKD3O94806 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRKD3O94806 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRKD3O94806 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
PRKD3O94806 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRKD3O94806 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRKD3O94806 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRKD3O94806 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRKD3O94806 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRKD3O94806 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRKD3O94806 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRKD3O94806 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
PRKD3O94806 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRKD3O94806 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRKD3O94806 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRKD3O94806 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRKD3O94806 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRKD3O94806 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRKD3O94806 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRKD3O94806 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRKD3O94806 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRKD3O94806 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRKD3O94806 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRKD3O94806 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRKD3O94806 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRKD3O94806 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRKD3O94806 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRKD3O94806 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRKD3O94806 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRKD3O94806 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRKD3O94806 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRKD3O94806 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRKD3O94806 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PRKD3O94806 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRKD3O94806 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRKD3O94806 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRKD3O94806 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRKD3O94806 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRKD3O94806 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRKD3O94806 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRKD3O94806 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRKD3O94806 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRKD3O94806 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRKD3O94806 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRKD3O94806 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRKD3O94806 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRKD3O94806 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRKD3O94806 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PRKD3O94806 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PRKD3O94806 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PRKD3O94806 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
PRKD3O94806 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PRKD3O94806 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
PRKD3O94806 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PRKD3O94806 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRKD3O94806 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRKD3O94806 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRKD3O94806 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRKD3O94806 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRKD3O94806 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRKD3O94806 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRKD3O94806 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRKD3O94806 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRKD3O94806 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRKD3O94806 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRKD3O94806 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRKD3O94806 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRKD3O94806 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRKD3O94806 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRKD3O94806 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRKD3O94806 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRKD3O94806 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRKD3O94806 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRKD3O94806 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRKD3O94806 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRKD3O94806 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRKD3O94806 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRKD3O94806 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRKD3O94806 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
PRKD3O94806 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRKD3O94806 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRKD3O94806 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRKD3O94806 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRKD3O94806 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRKD3O94806 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRKD3O94806 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRKD3O94806 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRKD3O94806 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRKD3O94806 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PRKD3O94806 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRKD3O94806 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRKD3O94806 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRKD3O94806 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRKD3O94806 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72 ms