Protein–RNA interactions for Protein: O94788

ALDH1A2, Retinal dehydrogenase 2, humanhuman

Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALDH1A2O94788 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ALDH1A2O94788 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ALDH1A2O94788 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ALDH1A2O94788 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ALDH1A2O94788 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ALDH1A2O94788 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ALDH1A2O94788 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ALDH1A2O94788 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ALDH1A2O94788 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ALDH1A2O94788 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ALDH1A2O94788 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ALDH1A2O94788 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ALDH1A2O94788 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ALDH1A2O94788 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ALDH1A2O94788 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ALDH1A2O94788 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ALDH1A2O94788 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ALDH1A2O94788 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ALDH1A2O94788 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ALDH1A2O94788 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ALDH1A2O94788 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ALDH1A2O94788 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ALDH1A2O94788 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
ALDH1A2O94788 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ALDH1A2O94788 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ALDH1A2O94788 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ALDH1A2O94788 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ALDH1A2O94788 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ALDH1A2O94788 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ALDH1A2O94788 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
ALDH1A2O94788 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ALDH1A2O94788 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ALDH1A2O94788 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ALDH1A2O94788 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ALDH1A2O94788 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ALDH1A2O94788 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ALDH1A2O94788 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ALDH1A2O94788 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ALDH1A2O94788 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ALDH1A2O94788 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ALDH1A2O94788 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ALDH1A2O94788 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ALDH1A2O94788 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ALDH1A2O94788 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ALDH1A2O94788 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ALDH1A2O94788 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ALDH1A2O94788 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ALDH1A2O94788 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ALDH1A2O94788 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ALDH1A2O94788 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ALDH1A2O94788 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ALDH1A2O94788 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ALDH1A2O94788 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ALDH1A2O94788 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ALDH1A2O94788 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ALDH1A2O94788 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ALDH1A2O94788 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ALDH1A2O94788 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
ALDH1A2O94788 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ALDH1A2O94788 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ALDH1A2O94788 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ALDH1A2O94788 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ALDH1A2O94788 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ALDH1A2O94788 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ALDH1A2O94788 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ALDH1A2O94788 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ALDH1A2O94788 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ALDH1A2O94788 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ALDH1A2O94788 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ALDH1A2O94788 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
ALDH1A2O94788 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ALDH1A2O94788 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
ALDH1A2O94788 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
ALDH1A2O94788 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ALDH1A2O94788 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ALDH1A2O94788 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ALDH1A2O94788 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ALDH1A2O94788 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ALDH1A2O94788 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ALDH1A2O94788 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ALDH1A2O94788 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ALDH1A2O94788 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ALDH1A2O94788 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ALDH1A2O94788 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ALDH1A2O94788 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ALDH1A2O94788 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ALDH1A2O94788 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ALDH1A2O94788 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ALDH1A2O94788 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ALDH1A2O94788 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ALDH1A2O94788 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ALDH1A2O94788 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
ALDH1A2O94788 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ALDH1A2O94788 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ALDH1A2O94788 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ALDH1A2O94788 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ALDH1A2O94788 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ALDH1A2O94788 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ALDH1A2O94788 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
ALDH1A2O94788 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms