Protein–RNA interactions for Protein: O94769

ECM2, Extracellular matrix protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM2O94769 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
ECM2O94769 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
ECM2O94769 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
ECM2O94769 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
ECM2O94769 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
ECM2O94769 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
ECM2O94769 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
ECM2O94769 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
ECM2O94769 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
ECM2O94769 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
ECM2O94769 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
ECM2O94769 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
ECM2O94769 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
ECM2O94769 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
ECM2O94769 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ECM2O94769 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
ECM2O94769 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
ECM2O94769 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
ECM2O94769 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
ECM2O94769 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
ECM2O94769 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
ECM2O94769 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
ECM2O94769 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
ECM2O94769 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
ECM2O94769 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
ECM2O94769 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
ECM2O94769 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
ECM2O94769 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
ECM2O94769 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC27.66■■■□□ 2.02
ECM2O94769 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
ECM2O94769 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
ECM2O94769 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
ECM2O94769 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
ECM2O94769 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ECM2O94769 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ECM2O94769 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
ECM2O94769 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
ECM2O94769 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
ECM2O94769 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
ECM2O94769 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
ECM2O94769 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
ECM2O94769 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
ECM2O94769 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
ECM2O94769 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ECM2O94769 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ECM2O94769 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
ECM2O94769 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
ECM2O94769 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
ECM2O94769 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ECM2O94769 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ECM2O94769 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ECM2O94769 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
ECM2O94769 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
ECM2O94769 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ECM2O94769 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ECM2O94769 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ECM2O94769 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ECM2O94769 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ECM2O94769 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ECM2O94769 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
ECM2O94769 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ECM2O94769 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ECM2O94769 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ECM2O94769 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
ECM2O94769 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ECM2O94769 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ECM2O94769 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
ECM2O94769 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
ECM2O94769 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ECM2O94769 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ECM2O94769 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
ECM2O94769 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC27.58■■■□□ 2.01
ECM2O94769 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ECM2O94769 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ECM2O94769 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2
ECM2O94769 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ECM2O94769 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
ECM2O94769 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
ECM2O94769 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
ECM2O94769 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ECM2O94769 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
ECM2O94769 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
ECM2O94769 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ECM2O94769 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ECM2O94769 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
ECM2O94769 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC27.56■■■□□ 2
ECM2O94769 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ECM2O94769 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
ECM2O94769 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ECM2O94769 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ECM2O94769 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ECM2O94769 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ECM2O94769 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
ECM2O94769 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ECM2O94769 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
ECM2O94769 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ECM2O94769 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ECM2O94769 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
ECM2O94769 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC27.54■■■□□ 2
ECM2O94769 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms