Protein–RNA interactions for Protein: O76015

KRT38, Keratin, type I cuticular Ha8, humanhuman

Predictions only

Length 456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT38O76015 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
KRT38O76015 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
KRT38O76015 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
KRT38O76015 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
KRT38O76015 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
KRT38O76015 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
KRT38O76015 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
KRT38O76015 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
KRT38O76015 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
KRT38O76015 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
KRT38O76015 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
KRT38O76015 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
KRT38O76015 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
KRT38O76015 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
KRT38O76015 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
KRT38O76015 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
KRT38O76015 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
KRT38O76015 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
KRT38O76015 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
KRT38O76015 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
KRT38O76015 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
KRT38O76015 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
KRT38O76015 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
KRT38O76015 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
KRT38O76015 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
KRT38O76015 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
KRT38O76015 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
KRT38O76015 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
KRT38O76015 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
KRT38O76015 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
KRT38O76015 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
KRT38O76015 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
KRT38O76015 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
KRT38O76015 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.87■■□□□ 1.41
KRT38O76015 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
KRT38O76015 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
KRT38O76015 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
KRT38O76015 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
KRT38O76015 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
KRT38O76015 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
KRT38O76015 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
KRT38O76015 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
KRT38O76015 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
KRT38O76015 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
KRT38O76015 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
KRT38O76015 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
KRT38O76015 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
KRT38O76015 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
KRT38O76015 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
KRT38O76015 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
KRT38O76015 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
KRT38O76015 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
KRT38O76015 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
KRT38O76015 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
KRT38O76015 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
KRT38O76015 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
KRT38O76015 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
KRT38O76015 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
KRT38O76015 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
KRT38O76015 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
KRT38O76015 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
KRT38O76015 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
KRT38O76015 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
KRT38O76015 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
KRT38O76015 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
KRT38O76015 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
KRT38O76015 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
KRT38O76015 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
KRT38O76015 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
KRT38O76015 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
KRT38O76015 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
KRT38O76015 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
KRT38O76015 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
KRT38O76015 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
KRT38O76015 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
KRT38O76015 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
KRT38O76015 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
KRT38O76015 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
KRT38O76015 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
KRT38O76015 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
KRT38O76015 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
KRT38O76015 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
KRT38O76015 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
KRT38O76015 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
KRT38O76015 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
KRT38O76015 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
KRT38O76015 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
KRT38O76015 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
KRT38O76015 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
KRT38O76015 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
KRT38O76015 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
KRT38O76015 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
KRT38O76015 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
KRT38O76015 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
KRT38O76015 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
KRT38O76015 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
KRT38O76015 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
KRT38O76015 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
KRT38O76015 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
KRT38O76015 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms