Protein–RNA interactions for Protein: O75688

PPM1B, Protein phosphatase 1B, humanhuman

Predictions only

Length 479 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPM1BO75688 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
PPM1BO75688 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PPM1BO75688 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PPM1BO75688 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PPM1BO75688 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PPM1BO75688 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PPM1BO75688 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
PPM1BO75688 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PPM1BO75688 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PPM1BO75688 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PPM1BO75688 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PPM1BO75688 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PPM1BO75688 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PPM1BO75688 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PPM1BO75688 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
PPM1BO75688 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PPM1BO75688 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PPM1BO75688 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PPM1BO75688 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PPM1BO75688 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PPM1BO75688 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PPM1BO75688 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PPM1BO75688 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PPM1BO75688 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PPM1BO75688 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PPM1BO75688 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PPM1BO75688 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PPM1BO75688 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PPM1BO75688 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PPM1BO75688 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PPM1BO75688 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PPM1BO75688 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PPM1BO75688 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PPM1BO75688 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PPM1BO75688 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PPM1BO75688 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PPM1BO75688 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PPM1BO75688 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PPM1BO75688 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PPM1BO75688 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PPM1BO75688 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PPM1BO75688 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PPM1BO75688 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PPM1BO75688 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PPM1BO75688 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PPM1BO75688 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PPM1BO75688 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PPM1BO75688 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PPM1BO75688 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PPM1BO75688 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PPM1BO75688 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PPM1BO75688 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PPM1BO75688 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PPM1BO75688 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PPM1BO75688 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PPM1BO75688 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PPM1BO75688 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PPM1BO75688 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PPM1BO75688 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
PPM1BO75688 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PPM1BO75688 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PPM1BO75688 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PPM1BO75688 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PPM1BO75688 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PPM1BO75688 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PPM1BO75688 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PPM1BO75688 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PPM1BO75688 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PPM1BO75688 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PPM1BO75688 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PPM1BO75688 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PPM1BO75688 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PPM1BO75688 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PPM1BO75688 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PPM1BO75688 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PPM1BO75688 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PPM1BO75688 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PPM1BO75688 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PPM1BO75688 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PPM1BO75688 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PPM1BO75688 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PPM1BO75688 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PPM1BO75688 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PPM1BO75688 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PPM1BO75688 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PPM1BO75688 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PPM1BO75688 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PPM1BO75688 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PPM1BO75688 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PPM1BO75688 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PPM1BO75688 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PPM1BO75688 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PPM1BO75688 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PPM1BO75688 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PPM1BO75688 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PPM1BO75688 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PPM1BO75688 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PPM1BO75688 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PPM1BO75688 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PPM1BO75688 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms