Protein–RNA interactions for Protein: O75607

NPM3, Nucleoplasmin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPM3O75607 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
NPM3O75607 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
NPM3O75607 LST1-204ENST00000376086 554 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
NPM3O75607 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
NPM3O75607 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
NPM3O75607 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
NPM3O75607 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC28.51■■■□□ 2.15
NPM3O75607 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
NPM3O75607 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
NPM3O75607 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
NPM3O75607 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
NPM3O75607 LINC01551-203ENST00000550266 455 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
NPM3O75607 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
NPM3O75607 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
NPM3O75607 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
NPM3O75607 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
NPM3O75607 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
NPM3O75607 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
NPM3O75607 IL12A-202ENST00000466512 1283 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
NPM3O75607 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
NPM3O75607 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
NPM3O75607 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
NPM3O75607 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
NPM3O75607 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
NPM3O75607 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
NPM3O75607 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
NPM3O75607 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
NPM3O75607 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
NPM3O75607 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
NPM3O75607 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
NPM3O75607 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
NPM3O75607 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
NPM3O75607 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
NPM3O75607 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
NPM3O75607 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
NPM3O75607 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
NPM3O75607 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
NPM3O75607 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
NPM3O75607 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
NPM3O75607 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
NPM3O75607 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
NPM3O75607 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
NPM3O75607 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
NPM3O75607 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
NPM3O75607 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
NPM3O75607 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
NPM3O75607 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
NPM3O75607 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
NPM3O75607 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
NPM3O75607 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
NPM3O75607 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
NPM3O75607 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
NPM3O75607 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
NPM3O75607 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
NPM3O75607 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
NPM3O75607 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
NPM3O75607 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
NPM3O75607 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
NPM3O75607 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
NPM3O75607 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
NPM3O75607 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
NPM3O75607 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
NPM3O75607 HAPLN1-206ENST00000514416 1145 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
NPM3O75607 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
NPM3O75607 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
NPM3O75607 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
NPM3O75607 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
NPM3O75607 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
NPM3O75607 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
NPM3O75607 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
NPM3O75607 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
NPM3O75607 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
NPM3O75607 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
NPM3O75607 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
NPM3O75607 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
NPM3O75607 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
NPM3O75607 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
NPM3O75607 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
NPM3O75607 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
NPM3O75607 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
NPM3O75607 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
NPM3O75607 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
NPM3O75607 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
NPM3O75607 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
NPM3O75607 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
NPM3O75607 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
NPM3O75607 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
NPM3O75607 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
NPM3O75607 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
NPM3O75607 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
NPM3O75607 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
NPM3O75607 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
NPM3O75607 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
NPM3O75607 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
NPM3O75607 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
NPM3O75607 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
NPM3O75607 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
NPM3O75607 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
NPM3O75607 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
NPM3O75607 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 161.6 ms