Protein–RNA interactions for Protein: O75534

CSDE1, Cold shock domain-containing protein E1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSDE1O75534 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CSDE1O75534 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CSDE1O75534 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CSDE1O75534 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CSDE1O75534 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CSDE1O75534 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CSDE1O75534 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CSDE1O75534 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CSDE1O75534 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CSDE1O75534 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CSDE1O75534 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CSDE1O75534 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CSDE1O75534 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CSDE1O75534 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CSDE1O75534 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CSDE1O75534 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CSDE1O75534 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CSDE1O75534 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CSDE1O75534 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CSDE1O75534 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CSDE1O75534 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
CSDE1O75534 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CSDE1O75534 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CSDE1O75534 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CSDE1O75534 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CSDE1O75534 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CSDE1O75534 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
CSDE1O75534 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CSDE1O75534 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CSDE1O75534 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CSDE1O75534 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CSDE1O75534 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CSDE1O75534 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CSDE1O75534 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CSDE1O75534 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CSDE1O75534 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CSDE1O75534 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CSDE1O75534 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CSDE1O75534 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CSDE1O75534 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CSDE1O75534 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CSDE1O75534 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CSDE1O75534 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CSDE1O75534 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CSDE1O75534 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
CSDE1O75534 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CSDE1O75534 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CSDE1O75534 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CSDE1O75534 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CSDE1O75534 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CSDE1O75534 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CSDE1O75534 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CSDE1O75534 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CSDE1O75534 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CSDE1O75534 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CSDE1O75534 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
CSDE1O75534 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CSDE1O75534 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CSDE1O75534 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CSDE1O75534 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CSDE1O75534 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CSDE1O75534 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CSDE1O75534 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CSDE1O75534 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
CSDE1O75534 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CSDE1O75534 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CSDE1O75534 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CSDE1O75534 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.79
CSDE1O75534 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
CSDE1O75534 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CSDE1O75534 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CSDE1O75534 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CSDE1O75534 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CSDE1O75534 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CSDE1O75534 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CSDE1O75534 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CSDE1O75534 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CSDE1O75534 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CSDE1O75534 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
CSDE1O75534 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CSDE1O75534 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CSDE1O75534 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CSDE1O75534 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CSDE1O75534 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CSDE1O75534 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CSDE1O75534 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
CSDE1O75534 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CSDE1O75534 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CSDE1O75534 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CSDE1O75534 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CSDE1O75534 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CSDE1O75534 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CSDE1O75534 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CSDE1O75534 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CSDE1O75534 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CSDE1O75534 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CSDE1O75534 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CSDE1O75534 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CSDE1O75534 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
CSDE1O75534 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms