Protein–RNA interactions for Protein: O75427

LRCH4, Leucine-rich repeat and calponin homology domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRCH4O75427 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
LRCH4O75427 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
LRCH4O75427 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
LRCH4O75427 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
LRCH4O75427 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
LRCH4O75427 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
LRCH4O75427 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
LRCH4O75427 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
LRCH4O75427 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LRCH4O75427 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
LRCH4O75427 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
LRCH4O75427 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
LRCH4O75427 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LRCH4O75427 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LRCH4O75427 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LRCH4O75427 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
LRCH4O75427 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
LRCH4O75427 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
LRCH4O75427 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LRCH4O75427 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
LRCH4O75427 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LRCH4O75427 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LRCH4O75427 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LRCH4O75427 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LRCH4O75427 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LRCH4O75427 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LRCH4O75427 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LRCH4O75427 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LRCH4O75427 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LRCH4O75427 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LRCH4O75427 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LRCH4O75427 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
LRCH4O75427 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LRCH4O75427 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LRCH4O75427 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
LRCH4O75427 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
LRCH4O75427 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
LRCH4O75427 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
LRCH4O75427 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
LRCH4O75427 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
LRCH4O75427 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LRCH4O75427 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LRCH4O75427 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
LRCH4O75427 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
LRCH4O75427 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
LRCH4O75427 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
LRCH4O75427 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
LRCH4O75427 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LRCH4O75427 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
LRCH4O75427 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LRCH4O75427 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
LRCH4O75427 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
LRCH4O75427 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LRCH4O75427 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
LRCH4O75427 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
LRCH4O75427 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
LRCH4O75427 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
LRCH4O75427 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
LRCH4O75427 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
LRCH4O75427 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
LRCH4O75427 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
LRCH4O75427 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LRCH4O75427 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LRCH4O75427 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LRCH4O75427 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LRCH4O75427 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
LRCH4O75427 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LRCH4O75427 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LRCH4O75427 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LRCH4O75427 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LRCH4O75427 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LRCH4O75427 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LRCH4O75427 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
LRCH4O75427 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LRCH4O75427 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LRCH4O75427 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
LRCH4O75427 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LRCH4O75427 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LRCH4O75427 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LRCH4O75427 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
LRCH4O75427 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
LRCH4O75427 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
LRCH4O75427 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
LRCH4O75427 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
LRCH4O75427 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
LRCH4O75427 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
LRCH4O75427 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LRCH4O75427 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LRCH4O75427 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LRCH4O75427 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LRCH4O75427 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
LRCH4O75427 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LRCH4O75427 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LRCH4O75427 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LRCH4O75427 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
LRCH4O75427 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
LRCH4O75427 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
LRCH4O75427 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
LRCH4O75427 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
LRCH4O75427 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms