Protein–RNA interactions for Protein: O75400

PRPF40A, Pre-mRNA-processing factor 40 homolog A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 957 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF40AO75400 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PRPF40AO75400 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PRPF40AO75400 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PRPF40AO75400 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PRPF40AO75400 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PRPF40AO75400 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PRPF40AO75400 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
PRPF40AO75400 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PRPF40AO75400 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
PRPF40AO75400 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
PRPF40AO75400 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
PRPF40AO75400 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
PRPF40AO75400 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
PRPF40AO75400 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
PRPF40AO75400 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
PRPF40AO75400 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
PRPF40AO75400 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PRPF40AO75400 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PRPF40AO75400 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PRPF40AO75400 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PRPF40AO75400 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
PRPF40AO75400 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
PRPF40AO75400 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC27.64■■■□□ 2.02
PRPF40AO75400 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
PRPF40AO75400 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PRPF40AO75400 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PRPF40AO75400 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PRPF40AO75400 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PRPF40AO75400 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
PRPF40AO75400 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PRPF40AO75400 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PRPF40AO75400 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PRPF40AO75400 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PRPF40AO75400 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PRPF40AO75400 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PRPF40AO75400 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PRPF40AO75400 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PRPF40AO75400 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PRPF40AO75400 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PRPF40AO75400 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PRPF40AO75400 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PRPF40AO75400 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
PRPF40AO75400 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PRPF40AO75400 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PRPF40AO75400 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PRPF40AO75400 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PRPF40AO75400 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PRPF40AO75400 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PRPF40AO75400 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PRPF40AO75400 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PRPF40AO75400 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PRPF40AO75400 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PRPF40AO75400 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PRPF40AO75400 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PRPF40AO75400 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PRPF40AO75400 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PRPF40AO75400 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
PRPF40AO75400 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PRPF40AO75400 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PRPF40AO75400 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PRPF40AO75400 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PRPF40AO75400 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PRPF40AO75400 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PRPF40AO75400 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PRPF40AO75400 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PRPF40AO75400 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PRPF40AO75400 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PRPF40AO75400 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PRPF40AO75400 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PRPF40AO75400 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PRPF40AO75400 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PRPF40AO75400 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PRPF40AO75400 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PRPF40AO75400 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PRPF40AO75400 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PRPF40AO75400 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PRPF40AO75400 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PRPF40AO75400 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
PRPF40AO75400 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PRPF40AO75400 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PRPF40AO75400 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PRPF40AO75400 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
PRPF40AO75400 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PRPF40AO75400 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PRPF40AO75400 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC27.56■■■□□ 2
PRPF40AO75400 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PRPF40AO75400 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PRPF40AO75400 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC27.56■■■□□ 2
PRPF40AO75400 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PRPF40AO75400 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
PRPF40AO75400 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC27.55■■■□□ 2
PRPF40AO75400 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC27.55■■■□□ 2
PRPF40AO75400 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PRPF40AO75400 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PRPF40AO75400 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PRPF40AO75400 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PRPF40AO75400 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PRPF40AO75400 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
PRPF40AO75400 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PRPF40AO75400 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC27.54■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 428.6 ms