Protein–RNA interactions for Protein: O60936

NOL3, Nucleolar protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOL3O60936 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NOL3O60936 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NOL3O60936 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NOL3O60936 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NOL3O60936 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NOL3O60936 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NOL3O60936 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
NOL3O60936 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NOL3O60936 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NOL3O60936 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NOL3O60936 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NOL3O60936 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NOL3O60936 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NOL3O60936 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NOL3O60936 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NOL3O60936 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NOL3O60936 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NOL3O60936 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NOL3O60936 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NOL3O60936 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NOL3O60936 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NOL3O60936 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NOL3O60936 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NOL3O60936 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NOL3O60936 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NOL3O60936 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NOL3O60936 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NOL3O60936 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NOL3O60936 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NOL3O60936 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NOL3O60936 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NOL3O60936 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NOL3O60936 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NOL3O60936 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NOL3O60936 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NOL3O60936 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NOL3O60936 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NOL3O60936 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NOL3O60936 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NOL3O60936 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NOL3O60936 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NOL3O60936 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NOL3O60936 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NOL3O60936 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NOL3O60936 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NOL3O60936 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NOL3O60936 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NOL3O60936 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NOL3O60936 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NOL3O60936 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NOL3O60936 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
NOL3O60936 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
NOL3O60936 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
NOL3O60936 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
NOL3O60936 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NOL3O60936 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NOL3O60936 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NOL3O60936 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NOL3O60936 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NOL3O60936 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NOL3O60936 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NOL3O60936 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NOL3O60936 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NOL3O60936 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NOL3O60936 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NOL3O60936 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
NOL3O60936 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NOL3O60936 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NOL3O60936 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NOL3O60936 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NOL3O60936 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NOL3O60936 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NOL3O60936 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NOL3O60936 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NOL3O60936 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NOL3O60936 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NOL3O60936 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NOL3O60936 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NOL3O60936 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NOL3O60936 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NOL3O60936 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NOL3O60936 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NOL3O60936 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NOL3O60936 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NOL3O60936 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NOL3O60936 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NOL3O60936 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NOL3O60936 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NOL3O60936 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NOL3O60936 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NOL3O60936 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NOL3O60936 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NOL3O60936 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NOL3O60936 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NOL3O60936 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
NOL3O60936 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NOL3O60936 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NOL3O60936 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NOL3O60936 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NOL3O60936 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms