Protein–RNA interactions for Protein: O60662

KLHL41, Kelch-like protein 41, humanhuman

Predictions only

Length 606 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL41O60662 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
KLHL41O60662 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
KLHL41O60662 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KLHL41O60662 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
KLHL41O60662 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
KLHL41O60662 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KLHL41O60662 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KLHL41O60662 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KLHL41O60662 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
KLHL41O60662 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
KLHL41O60662 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KLHL41O60662 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KLHL41O60662 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
KLHL41O60662 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KLHL41O60662 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KLHL41O60662 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KLHL41O60662 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
KLHL41O60662 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KLHL41O60662 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KLHL41O60662 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KLHL41O60662 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KLHL41O60662 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KLHL41O60662 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
KLHL41O60662 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
KLHL41O60662 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KLHL41O60662 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
KLHL41O60662 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
KLHL41O60662 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KLHL41O60662 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
KLHL41O60662 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
KLHL41O60662 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KLHL41O60662 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
KLHL41O60662 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KLHL41O60662 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KLHL41O60662 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KLHL41O60662 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
KLHL41O60662 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KLHL41O60662 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
KLHL41O60662 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KLHL41O60662 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KLHL41O60662 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
KLHL41O60662 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KLHL41O60662 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
KLHL41O60662 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
KLHL41O60662 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
KLHL41O60662 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
KLHL41O60662 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
KLHL41O60662 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
KLHL41O60662 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
KLHL41O60662 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
KLHL41O60662 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
KLHL41O60662 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KLHL41O60662 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KLHL41O60662 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KLHL41O60662 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KLHL41O60662 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KLHL41O60662 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KLHL41O60662 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KLHL41O60662 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
KLHL41O60662 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KLHL41O60662 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KLHL41O60662 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KLHL41O60662 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KLHL41O60662 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KLHL41O60662 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KLHL41O60662 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KLHL41O60662 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KLHL41O60662 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KLHL41O60662 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KLHL41O60662 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KLHL41O60662 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KLHL41O60662 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KLHL41O60662 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KLHL41O60662 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KLHL41O60662 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KLHL41O60662 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KLHL41O60662 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KLHL41O60662 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KLHL41O60662 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KLHL41O60662 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KLHL41O60662 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KLHL41O60662 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KLHL41O60662 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
KLHL41O60662 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
KLHL41O60662 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
KLHL41O60662 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
KLHL41O60662 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
KLHL41O60662 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
KLHL41O60662 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
KLHL41O60662 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KLHL41O60662 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KLHL41O60662 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
KLHL41O60662 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KLHL41O60662 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KLHL41O60662 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KLHL41O60662 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KLHL41O60662 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KLHL41O60662 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
KLHL41O60662 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KLHL41O60662 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13 ms