Protein–RNA interactions for Protein: O60337

MARCH6, E3 ubiquitin-protein ligase MARCH6, humanhuman

Predictions only

Length 910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MARCH6O60337 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
MARCH6O60337 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
MARCH6O60337 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
MARCH6O60337 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
MARCH6O60337 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
MARCH6O60337 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
MARCH6O60337 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
MARCH6O60337 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
MARCH6O60337 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
MARCH6O60337 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
MARCH6O60337 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
MARCH6O60337 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
MARCH6O60337 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
MARCH6O60337 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
MARCH6O60337 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
MARCH6O60337 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
MARCH6O60337 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
MARCH6O60337 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
MARCH6O60337 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
MARCH6O60337 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
MARCH6O60337 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
MARCH6O60337 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
MARCH6O60337 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
MARCH6O60337 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
MARCH6O60337 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
MARCH6O60337 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
MARCH6O60337 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
MARCH6O60337 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
MARCH6O60337 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
MARCH6O60337 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
MARCH6O60337 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
MARCH6O60337 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
MARCH6O60337 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
MARCH6O60337 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
MARCH6O60337 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
MARCH6O60337 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
MARCH6O60337 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
MARCH6O60337 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
MARCH6O60337 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
MARCH6O60337 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
MARCH6O60337 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
MARCH6O60337 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
MARCH6O60337 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
MARCH6O60337 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
MARCH6O60337 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
MARCH6O60337 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
MARCH6O60337 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
MARCH6O60337 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
MARCH6O60337 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
MARCH6O60337 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
MARCH6O60337 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
MARCH6O60337 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
MARCH6O60337 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
MARCH6O60337 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
MARCH6O60337 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
MARCH6O60337 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
MARCH6O60337 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
MARCH6O60337 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
MARCH6O60337 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
MARCH6O60337 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
MARCH6O60337 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
MARCH6O60337 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
MARCH6O60337 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
MARCH6O60337 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
MARCH6O60337 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
MARCH6O60337 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
MARCH6O60337 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
MARCH6O60337 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
MARCH6O60337 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
MARCH6O60337 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
MARCH6O60337 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
MARCH6O60337 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
MARCH6O60337 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
MARCH6O60337 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
MARCH6O60337 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
MARCH6O60337 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
MARCH6O60337 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
MARCH6O60337 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
MARCH6O60337 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
MARCH6O60337 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
MARCH6O60337 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
MARCH6O60337 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
MARCH6O60337 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
MARCH6O60337 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
MARCH6O60337 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
MARCH6O60337 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
MARCH6O60337 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
MARCH6O60337 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
MARCH6O60337 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC27■■□□□ 1.91
MARCH6O60337 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
MARCH6O60337 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
MARCH6O60337 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
MARCH6O60337 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
MARCH6O60337 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
MARCH6O60337 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
MARCH6O60337 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
MARCH6O60337 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
MARCH6O60337 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
MARCH6O60337 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
MARCH6O60337 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms