Protein–RNA interactions for Protein: O60294

LCMT2, tRNA wybutosine-synthesizing protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 686 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCMT2O60294 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LCMT2O60294 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LCMT2O60294 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LCMT2O60294 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
LCMT2O60294 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
LCMT2O60294 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LCMT2O60294 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LCMT2O60294 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LCMT2O60294 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LCMT2O60294 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LCMT2O60294 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LCMT2O60294 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LCMT2O60294 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LCMT2O60294 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LCMT2O60294 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LCMT2O60294 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LCMT2O60294 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
LCMT2O60294 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LCMT2O60294 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LCMT2O60294 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LCMT2O60294 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LCMT2O60294 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LCMT2O60294 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LCMT2O60294 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LCMT2O60294 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LCMT2O60294 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LCMT2O60294 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
LCMT2O60294 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LCMT2O60294 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LCMT2O60294 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LCMT2O60294 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LCMT2O60294 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LCMT2O60294 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LCMT2O60294 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LCMT2O60294 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LCMT2O60294 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LCMT2O60294 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LCMT2O60294 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LCMT2O60294 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LCMT2O60294 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
LCMT2O60294 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LCMT2O60294 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LCMT2O60294 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LCMT2O60294 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LCMT2O60294 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LCMT2O60294 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LCMT2O60294 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
LCMT2O60294 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LCMT2O60294 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LCMT2O60294 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LCMT2O60294 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
LCMT2O60294 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LCMT2O60294 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LCMT2O60294 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LCMT2O60294 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LCMT2O60294 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LCMT2O60294 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LCMT2O60294 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LCMT2O60294 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LCMT2O60294 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LCMT2O60294 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
LCMT2O60294 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LCMT2O60294 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LCMT2O60294 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LCMT2O60294 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LCMT2O60294 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LCMT2O60294 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LCMT2O60294 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LCMT2O60294 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LCMT2O60294 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LCMT2O60294 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LCMT2O60294 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LCMT2O60294 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LCMT2O60294 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LCMT2O60294 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LCMT2O60294 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
LCMT2O60294 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LCMT2O60294 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LCMT2O60294 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LCMT2O60294 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LCMT2O60294 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LCMT2O60294 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LCMT2O60294 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LCMT2O60294 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LCMT2O60294 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LCMT2O60294 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LCMT2O60294 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LCMT2O60294 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LCMT2O60294 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LCMT2O60294 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LCMT2O60294 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LCMT2O60294 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LCMT2O60294 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
LCMT2O60294 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LCMT2O60294 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LCMT2O60294 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LCMT2O60294 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LCMT2O60294 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LCMT2O60294 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LCMT2O60294 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms