Protein–RNA interactions for Protein: O60225

SSX5, Protein SSX5, humanhuman

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX5O60225 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SSX5O60225 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SSX5O60225 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SSX5O60225 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SSX5O60225 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
SSX5O60225 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SSX5O60225 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
SSX5O60225 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
SSX5O60225 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
SSX5O60225 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
SSX5O60225 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
SSX5O60225 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
SSX5O60225 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SSX5O60225 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SSX5O60225 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SSX5O60225 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SSX5O60225 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SSX5O60225 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SSX5O60225 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SSX5O60225 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SSX5O60225 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SSX5O60225 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SSX5O60225 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SSX5O60225 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SSX5O60225 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SSX5O60225 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SSX5O60225 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
SSX5O60225 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SSX5O60225 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SSX5O60225 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SSX5O60225 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SSX5O60225 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SSX5O60225 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SSX5O60225 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SSX5O60225 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
SSX5O60225 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SSX5O60225 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SSX5O60225 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SSX5O60225 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SSX5O60225 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SSX5O60225 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SSX5O60225 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SSX5O60225 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SSX5O60225 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SSX5O60225 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SSX5O60225 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SSX5O60225 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SSX5O60225 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SSX5O60225 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SSX5O60225 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SSX5O60225 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
SSX5O60225 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SSX5O60225 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SSX5O60225 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SSX5O60225 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SSX5O60225 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SSX5O60225 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SSX5O60225 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SSX5O60225 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SSX5O60225 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SSX5O60225 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SSX5O60225 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SSX5O60225 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SSX5O60225 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SSX5O60225 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SSX5O60225 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SSX5O60225 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SSX5O60225 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SSX5O60225 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SSX5O60225 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
SSX5O60225 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SSX5O60225 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SSX5O60225 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
SSX5O60225 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SSX5O60225 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SSX5O60225 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SSX5O60225 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SSX5O60225 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SSX5O60225 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SSX5O60225 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SSX5O60225 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SSX5O60225 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
SSX5O60225 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SSX5O60225 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SSX5O60225 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SSX5O60225 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SSX5O60225 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SSX5O60225 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SSX5O60225 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
SSX5O60225 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SSX5O60225 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
SSX5O60225 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SSX5O60225 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SSX5O60225 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SSX5O60225 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SSX5O60225 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SSX5O60225 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SSX5O60225 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SSX5O60225 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SSX5O60225 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms