Protein–RNA interactions for Protein: O43933

PEX1, Peroxisome biogenesis factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX1O43933 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PEX1O43933 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
PEX1O43933 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
PEX1O43933 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PEX1O43933 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PEX1O43933 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PEX1O43933 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PEX1O43933 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PEX1O43933 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PEX1O43933 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PEX1O43933 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PEX1O43933 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PEX1O43933 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PEX1O43933 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PEX1O43933 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
PEX1O43933 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PEX1O43933 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PEX1O43933 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PEX1O43933 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PEX1O43933 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PEX1O43933 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
PEX1O43933 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PEX1O43933 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PEX1O43933 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PEX1O43933 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PEX1O43933 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PEX1O43933 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PEX1O43933 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PEX1O43933 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PEX1O43933 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PEX1O43933 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PEX1O43933 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
PEX1O43933 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PEX1O43933 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PEX1O43933 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PEX1O43933 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PEX1O43933 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PEX1O43933 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PEX1O43933 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PEX1O43933 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PEX1O43933 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PEX1O43933 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PEX1O43933 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PEX1O43933 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
PEX1O43933 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PEX1O43933 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PEX1O43933 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PEX1O43933 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PEX1O43933 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PEX1O43933 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PEX1O43933 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PEX1O43933 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PEX1O43933 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PEX1O43933 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PEX1O43933 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PEX1O43933 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PEX1O43933 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23■■□□□ 1.27
PEX1O43933 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PEX1O43933 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PEX1O43933 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC23■■□□□ 1.27
PEX1O43933 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PEX1O43933 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PEX1O43933 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PEX1O43933 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PEX1O43933 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PEX1O43933 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
PEX1O43933 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PEX1O43933 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PEX1O43933 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PEX1O43933 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PEX1O43933 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PEX1O43933 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PEX1O43933 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PEX1O43933 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
PEX1O43933 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PEX1O43933 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PEX1O43933 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PEX1O43933 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PEX1O43933 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PEX1O43933 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PEX1O43933 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PEX1O43933 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PEX1O43933 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PEX1O43933 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PEX1O43933 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PEX1O43933 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PEX1O43933 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PEX1O43933 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
PEX1O43933 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PEX1O43933 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PEX1O43933 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PEX1O43933 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PEX1O43933 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PEX1O43933 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PEX1O43933 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PEX1O43933 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PEX1O43933 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PEX1O43933 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PEX1O43933 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PEX1O43933 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms