Protein–RNA interactions for Protein: O43929

ORC4, Origin recognition complex subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ORC4O43929 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
ORC4O43929 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
ORC4O43929 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
ORC4O43929 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
ORC4O43929 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
ORC4O43929 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
ORC4O43929 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
ORC4O43929 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
ORC4O43929 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
ORC4O43929 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
ORC4O43929 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
ORC4O43929 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
ORC4O43929 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
ORC4O43929 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
ORC4O43929 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
ORC4O43929 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
ORC4O43929 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
ORC4O43929 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
ORC4O43929 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC28.2■■■□□ 2.1
ORC4O43929 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC28.2■■■□□ 2.1
ORC4O43929 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
ORC4O43929 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
ORC4O43929 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
ORC4O43929 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
ORC4O43929 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
ORC4O43929 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
ORC4O43929 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
ORC4O43929 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
ORC4O43929 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC28.19■■■□□ 2.1
ORC4O43929 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
ORC4O43929 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
ORC4O43929 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
ORC4O43929 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
ORC4O43929 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
ORC4O43929 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
ORC4O43929 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
ORC4O43929 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
ORC4O43929 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
ORC4O43929 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
ORC4O43929 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
ORC4O43929 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC28.17■■■□□ 2.1
ORC4O43929 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC28.17■■■□□ 2.1
ORC4O43929 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
ORC4O43929 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
ORC4O43929 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
ORC4O43929 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
ORC4O43929 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
ORC4O43929 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
ORC4O43929 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
ORC4O43929 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
ORC4O43929 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
ORC4O43929 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
ORC4O43929 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
ORC4O43929 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
ORC4O43929 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
ORC4O43929 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
ORC4O43929 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
ORC4O43929 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
ORC4O43929 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
ORC4O43929 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
ORC4O43929 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
ORC4O43929 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
ORC4O43929 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
ORC4O43929 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
ORC4O43929 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ORC4O43929 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
ORC4O43929 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
ORC4O43929 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ORC4O43929 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ORC4O43929 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ORC4O43929 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
ORC4O43929 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ORC4O43929 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ORC4O43929 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ORC4O43929 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
ORC4O43929 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
ORC4O43929 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ORC4O43929 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
ORC4O43929 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ORC4O43929 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
ORC4O43929 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
ORC4O43929 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
ORC4O43929 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ORC4O43929 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ORC4O43929 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ORC4O43929 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
ORC4O43929 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ORC4O43929 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ORC4O43929 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ORC4O43929 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ORC4O43929 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
ORC4O43929 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
ORC4O43929 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
ORC4O43929 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.08
ORC4O43929 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ORC4O43929 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
ORC4O43929 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ORC4O43929 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ORC4O43929 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ORC4O43929 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms