Protein–RNA interactions for Protein: O43795

MYO1B, Unconventional myosin-Ib, humanhuman

Predictions only

Length 1,136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYO1BO43795 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
MYO1BO43795 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
MYO1BO43795 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
MYO1BO43795 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
MYO1BO43795 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
MYO1BO43795 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
MYO1BO43795 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
MYO1BO43795 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
MYO1BO43795 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
MYO1BO43795 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
MYO1BO43795 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
MYO1BO43795 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
MYO1BO43795 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
MYO1BO43795 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
MYO1BO43795 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
MYO1BO43795 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
MYO1BO43795 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
MYO1BO43795 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
MYO1BO43795 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
MYO1BO43795 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC28.85■■■□□ 2.21
MYO1BO43795 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
MYO1BO43795 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
MYO1BO43795 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
MYO1BO43795 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
MYO1BO43795 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
MYO1BO43795 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
MYO1BO43795 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
MYO1BO43795 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
MYO1BO43795 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
MYO1BO43795 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
MYO1BO43795 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
MYO1BO43795 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
MYO1BO43795 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
MYO1BO43795 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
MYO1BO43795 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
MYO1BO43795 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
MYO1BO43795 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
MYO1BO43795 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
MYO1BO43795 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
MYO1BO43795 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
MYO1BO43795 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
MYO1BO43795 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
MYO1BO43795 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
MYO1BO43795 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
MYO1BO43795 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
MYO1BO43795 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
MYO1BO43795 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
MYO1BO43795 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC28.8■■■□□ 2.2
MYO1BO43795 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
MYO1BO43795 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
MYO1BO43795 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
MYO1BO43795 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
MYO1BO43795 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
MYO1BO43795 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
MYO1BO43795 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
MYO1BO43795 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
MYO1BO43795 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
MYO1BO43795 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
MYO1BO43795 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
MYO1BO43795 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
MYO1BO43795 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
MYO1BO43795 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
MYO1BO43795 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
MYO1BO43795 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
MYO1BO43795 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
MYO1BO43795 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
MYO1BO43795 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
MYO1BO43795 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC28.77■■■□□ 2.2
MYO1BO43795 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
MYO1BO43795 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
MYO1BO43795 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
MYO1BO43795 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
MYO1BO43795 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
MYO1BO43795 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
MYO1BO43795 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
MYO1BO43795 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
MYO1BO43795 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
MYO1BO43795 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC28.76■■■□□ 2.19
MYO1BO43795 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC28.76■■■□□ 2.19
MYO1BO43795 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
MYO1BO43795 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC28.75■■■□□ 2.19
MYO1BO43795 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
MYO1BO43795 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
MYO1BO43795 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
MYO1BO43795 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
MYO1BO43795 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
MYO1BO43795 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
MYO1BO43795 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
MYO1BO43795 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
MYO1BO43795 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
MYO1BO43795 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
MYO1BO43795 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
MYO1BO43795 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
MYO1BO43795 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
MYO1BO43795 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
MYO1BO43795 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
MYO1BO43795 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
MYO1BO43795 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
MYO1BO43795 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
MYO1BO43795 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms