Protein–RNA interactions for Protein: O43765

SGTA, Small glutamine-rich tetratricopeptide repeat-containing protein alpha, humanhuman

Predictions only

Length 313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGTAO43765 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SGTAO43765 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SGTAO43765 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SGTAO43765 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SGTAO43765 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
SGTAO43765 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SGTAO43765 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SGTAO43765 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
SGTAO43765 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SGTAO43765 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SGTAO43765 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SGTAO43765 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SGTAO43765 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SGTAO43765 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SGTAO43765 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SGTAO43765 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SGTAO43765 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SGTAO43765 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SGTAO43765 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SGTAO43765 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
SGTAO43765 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SGTAO43765 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SGTAO43765 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
SGTAO43765 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SGTAO43765 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SGTAO43765 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SGTAO43765 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SGTAO43765 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SGTAO43765 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SGTAO43765 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SGTAO43765 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SGTAO43765 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SGTAO43765 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SGTAO43765 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SGTAO43765 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SGTAO43765 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
SGTAO43765 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SGTAO43765 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SGTAO43765 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SGTAO43765 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SGTAO43765 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SGTAO43765 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
SGTAO43765 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SGTAO43765 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SGTAO43765 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SGTAO43765 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SGTAO43765 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SGTAO43765 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SGTAO43765 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SGTAO43765 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SGTAO43765 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SGTAO43765 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SGTAO43765 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SGTAO43765 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SGTAO43765 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SGTAO43765 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SGTAO43765 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SGTAO43765 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SGTAO43765 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SGTAO43765 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SGTAO43765 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SGTAO43765 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SGTAO43765 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SGTAO43765 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SGTAO43765 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SGTAO43765 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SGTAO43765 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SGTAO43765 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SGTAO43765 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SGTAO43765 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SGTAO43765 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SGTAO43765 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SGTAO43765 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SGTAO43765 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
SGTAO43765 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
SGTAO43765 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SGTAO43765 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SGTAO43765 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SGTAO43765 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SGTAO43765 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SGTAO43765 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SGTAO43765 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SGTAO43765 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SGTAO43765 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SGTAO43765 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SGTAO43765 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SGTAO43765 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SGTAO43765 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SGTAO43765 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SGTAO43765 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SGTAO43765 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SGTAO43765 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SGTAO43765 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SGTAO43765 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SGTAO43765 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SGTAO43765 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SGTAO43765 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SGTAO43765 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SGTAO43765 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SGTAO43765 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 122.3 ms