Protein–RNA interactions for Protein: O43709

BUD23, Probable 18S rRNA (guanine-N(7))-methyltransferase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BUD23O43709 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
BUD23O43709 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
BUD23O43709 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
BUD23O43709 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
BUD23O43709 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
BUD23O43709 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
BUD23O43709 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
BUD23O43709 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
BUD23O43709 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
BUD23O43709 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
BUD23O43709 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
BUD23O43709 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
BUD23O43709 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
BUD23O43709 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
BUD23O43709 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
BUD23O43709 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
BUD23O43709 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
BUD23O43709 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
BUD23O43709 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
BUD23O43709 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
BUD23O43709 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
BUD23O43709 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
BUD23O43709 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
BUD23O43709 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
BUD23O43709 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
BUD23O43709 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
BUD23O43709 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
BUD23O43709 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
BUD23O43709 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
BUD23O43709 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
BUD23O43709 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
BUD23O43709 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
BUD23O43709 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
BUD23O43709 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
BUD23O43709 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
BUD23O43709 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
BUD23O43709 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
BUD23O43709 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
BUD23O43709 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
BUD23O43709 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
BUD23O43709 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
BUD23O43709 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
BUD23O43709 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
BUD23O43709 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
BUD23O43709 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
BUD23O43709 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
BUD23O43709 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
BUD23O43709 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
BUD23O43709 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
BUD23O43709 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
BUD23O43709 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
BUD23O43709 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
BUD23O43709 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
BUD23O43709 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
BUD23O43709 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
BUD23O43709 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
BUD23O43709 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
BUD23O43709 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
BUD23O43709 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
BUD23O43709 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
BUD23O43709 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
BUD23O43709 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
BUD23O43709 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
BUD23O43709 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
BUD23O43709 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
BUD23O43709 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
BUD23O43709 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
BUD23O43709 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
BUD23O43709 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
BUD23O43709 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
BUD23O43709 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
BUD23O43709 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
BUD23O43709 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
BUD23O43709 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
BUD23O43709 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
BUD23O43709 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
BUD23O43709 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
BUD23O43709 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24■■□□□ 1.43
BUD23O43709 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
BUD23O43709 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
BUD23O43709 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
BUD23O43709 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
BUD23O43709 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
BUD23O43709 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
BUD23O43709 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
BUD23O43709 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
BUD23O43709 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
BUD23O43709 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
BUD23O43709 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
BUD23O43709 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC23.98■■□□□ 1.43
BUD23O43709 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
BUD23O43709 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
BUD23O43709 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
BUD23O43709 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
BUD23O43709 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
BUD23O43709 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
BUD23O43709 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
BUD23O43709 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
BUD23O43709 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
BUD23O43709 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms