Protein–RNA interactions for Protein: O43674

NDUFB5, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 5, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFB5O43674 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NDUFB5O43674 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NDUFB5O43674 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NDUFB5O43674 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NDUFB5O43674 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NDUFB5O43674 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NDUFB5O43674 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NDUFB5O43674 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NDUFB5O43674 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NDUFB5O43674 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NDUFB5O43674 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NDUFB5O43674 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NDUFB5O43674 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NDUFB5O43674 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NDUFB5O43674 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NDUFB5O43674 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NDUFB5O43674 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NDUFB5O43674 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NDUFB5O43674 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NDUFB5O43674 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NDUFB5O43674 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
NDUFB5O43674 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NDUFB5O43674 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NDUFB5O43674 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NDUFB5O43674 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NDUFB5O43674 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NDUFB5O43674 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NDUFB5O43674 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NDUFB5O43674 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NDUFB5O43674 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NDUFB5O43674 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NDUFB5O43674 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NDUFB5O43674 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NDUFB5O43674 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NDUFB5O43674 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NDUFB5O43674 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
NDUFB5O43674 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
NDUFB5O43674 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NDUFB5O43674 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NDUFB5O43674 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
NDUFB5O43674 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NDUFB5O43674 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NDUFB5O43674 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NDUFB5O43674 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NDUFB5O43674 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NDUFB5O43674 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NDUFB5O43674 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NDUFB5O43674 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
NDUFB5O43674 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NDUFB5O43674 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NDUFB5O43674 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NDUFB5O43674 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NDUFB5O43674 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NDUFB5O43674 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
NDUFB5O43674 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NDUFB5O43674 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
NDUFB5O43674 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NDUFB5O43674 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NDUFB5O43674 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NDUFB5O43674 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NDUFB5O43674 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NDUFB5O43674 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NDUFB5O43674 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NDUFB5O43674 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NDUFB5O43674 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NDUFB5O43674 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
NDUFB5O43674 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NDUFB5O43674 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NDUFB5O43674 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NDUFB5O43674 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NDUFB5O43674 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
NDUFB5O43674 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NDUFB5O43674 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NDUFB5O43674 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NDUFB5O43674 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NDUFB5O43674 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NDUFB5O43674 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NDUFB5O43674 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NDUFB5O43674 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
NDUFB5O43674 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
NDUFB5O43674 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NDUFB5O43674 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NDUFB5O43674 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NDUFB5O43674 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NDUFB5O43674 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NDUFB5O43674 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NDUFB5O43674 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NDUFB5O43674 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NDUFB5O43674 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NDUFB5O43674 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NDUFB5O43674 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NDUFB5O43674 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NDUFB5O43674 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NDUFB5O43674 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NDUFB5O43674 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NDUFB5O43674 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NDUFB5O43674 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NDUFB5O43674 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NDUFB5O43674 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NDUFB5O43674 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.6 ms