Protein–RNA interactions for Protein: O43502

RAD51C, DNA repair protein RAD51 homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD51CO43502 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RAD51CO43502 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
RAD51CO43502 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RAD51CO43502 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RAD51CO43502 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RAD51CO43502 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RAD51CO43502 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RAD51CO43502 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RAD51CO43502 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
RAD51CO43502 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RAD51CO43502 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RAD51CO43502 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RAD51CO43502 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RAD51CO43502 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RAD51CO43502 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RAD51CO43502 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RAD51CO43502 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RAD51CO43502 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RAD51CO43502 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RAD51CO43502 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RAD51CO43502 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RAD51CO43502 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RAD51CO43502 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RAD51CO43502 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RAD51CO43502 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RAD51CO43502 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RAD51CO43502 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RAD51CO43502 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RAD51CO43502 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RAD51CO43502 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RAD51CO43502 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
RAD51CO43502 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
RAD51CO43502 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
RAD51CO43502 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
RAD51CO43502 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
RAD51CO43502 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
RAD51CO43502 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
RAD51CO43502 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
RAD51CO43502 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
RAD51CO43502 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
RAD51CO43502 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RAD51CO43502 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RAD51CO43502 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RAD51CO43502 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RAD51CO43502 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RAD51CO43502 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RAD51CO43502 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RAD51CO43502 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RAD51CO43502 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RAD51CO43502 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RAD51CO43502 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RAD51CO43502 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RAD51CO43502 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RAD51CO43502 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RAD51CO43502 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RAD51CO43502 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
RAD51CO43502 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
RAD51CO43502 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
RAD51CO43502 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RAD51CO43502 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RAD51CO43502 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RAD51CO43502 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RAD51CO43502 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RAD51CO43502 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RAD51CO43502 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
RAD51CO43502 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RAD51CO43502 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RAD51CO43502 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RAD51CO43502 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RAD51CO43502 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RAD51CO43502 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RAD51CO43502 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RAD51CO43502 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RAD51CO43502 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RAD51CO43502 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RAD51CO43502 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RAD51CO43502 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RAD51CO43502 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
RAD51CO43502 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RAD51CO43502 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RAD51CO43502 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RAD51CO43502 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RAD51CO43502 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RAD51CO43502 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
RAD51CO43502 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RAD51CO43502 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RAD51CO43502 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RAD51CO43502 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RAD51CO43502 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RAD51CO43502 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RAD51CO43502 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RAD51CO43502 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RAD51CO43502 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RAD51CO43502 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RAD51CO43502 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RAD51CO43502 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RAD51CO43502 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RAD51CO43502 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RAD51CO43502 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RAD51CO43502 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.1 ms