Protein–RNA interactions for Protein: O43448

KCNAB3, Voltage-gated potassium channel subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNAB3O43448 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
KCNAB3O43448 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
KCNAB3O43448 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
KCNAB3O43448 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
KCNAB3O43448 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
KCNAB3O43448 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
KCNAB3O43448 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
KCNAB3O43448 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
KCNAB3O43448 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
KCNAB3O43448 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
KCNAB3O43448 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
KCNAB3O43448 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
KCNAB3O43448 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
KCNAB3O43448 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
KCNAB3O43448 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
KCNAB3O43448 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
KCNAB3O43448 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
KCNAB3O43448 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
KCNAB3O43448 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
KCNAB3O43448 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
KCNAB3O43448 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
KCNAB3O43448 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
KCNAB3O43448 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
KCNAB3O43448 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
KCNAB3O43448 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
KCNAB3O43448 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
KCNAB3O43448 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
KCNAB3O43448 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
KCNAB3O43448 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
KCNAB3O43448 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
KCNAB3O43448 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
KCNAB3O43448 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
KCNAB3O43448 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
KCNAB3O43448 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
KCNAB3O43448 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
KCNAB3O43448 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
KCNAB3O43448 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
KCNAB3O43448 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
KCNAB3O43448 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
KCNAB3O43448 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
KCNAB3O43448 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
KCNAB3O43448 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
KCNAB3O43448 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
KCNAB3O43448 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
KCNAB3O43448 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
KCNAB3O43448 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
KCNAB3O43448 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
KCNAB3O43448 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
KCNAB3O43448 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
KCNAB3O43448 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
KCNAB3O43448 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
KCNAB3O43448 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
KCNAB3O43448 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
KCNAB3O43448 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
KCNAB3O43448 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
KCNAB3O43448 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
KCNAB3O43448 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
KCNAB3O43448 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
KCNAB3O43448 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
KCNAB3O43448 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
KCNAB3O43448 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
KCNAB3O43448 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
KCNAB3O43448 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
KCNAB3O43448 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
KCNAB3O43448 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
KCNAB3O43448 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
KCNAB3O43448 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
KCNAB3O43448 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
KCNAB3O43448 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
KCNAB3O43448 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
KCNAB3O43448 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
KCNAB3O43448 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
KCNAB3O43448 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
KCNAB3O43448 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
KCNAB3O43448 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
KCNAB3O43448 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
KCNAB3O43448 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
KCNAB3O43448 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
KCNAB3O43448 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
KCNAB3O43448 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
KCNAB3O43448 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
KCNAB3O43448 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
KCNAB3O43448 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
KCNAB3O43448 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
KCNAB3O43448 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
KCNAB3O43448 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
KCNAB3O43448 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
KCNAB3O43448 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
KCNAB3O43448 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
KCNAB3O43448 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
KCNAB3O43448 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
KCNAB3O43448 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
KCNAB3O43448 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
KCNAB3O43448 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
KCNAB3O43448 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
KCNAB3O43448 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
KCNAB3O43448 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
KCNAB3O43448 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
KCNAB3O43448 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
KCNAB3O43448 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms