Protein–RNA interactions for Protein: O43379

WDR62, WD repeat-containing protein 62, humanhuman

Predictions only

Length 1,518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR62O43379 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC41.34■■■■■ 4.21
WDR62O43379 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC41.34■■■■■ 4.21
WDR62O43379 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.34■■■■■ 4.21
WDR62O43379 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.34■■■■■ 4.21
WDR62O43379 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC41.34■■■■■ 4.21
WDR62O43379 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC41.34■■■■■ 4.21
WDR62O43379 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.34■■■■■ 4.21
WDR62O43379 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC41.33■■■■■ 4.21
WDR62O43379 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.32■■■■■ 4.21
WDR62O43379 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC41.32■■■■■ 4.2
WDR62O43379 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.31■■■■■ 4.2
WDR62O43379 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC41.31■■■■■ 4.2
WDR62O43379 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.31■■■■■ 4.2
WDR62O43379 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC41.31■■■■■ 4.2
WDR62O43379 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.31■■■■■ 4.2
WDR62O43379 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC41.31■■■■■ 4.2
WDR62O43379 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.31■■■■■ 4.2
WDR62O43379 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC41.3■■■■■ 4.2
WDR62O43379 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC41.29■■■■■ 4.2
WDR62O43379 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC41.28■■■■■ 4.2
WDR62O43379 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC41.28■■■■■ 4.2
WDR62O43379 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.28■■■■■ 4.2
WDR62O43379 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC41.28■■■■■ 4.2
WDR62O43379 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC41.28■■■■■ 4.2
WDR62O43379 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC41.28■■■■■ 4.2
WDR62O43379 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC41.28■■■■■ 4.2
WDR62O43379 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.28■■■■■ 4.2
WDR62O43379 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC41.27■■■■■ 4.2
WDR62O43379 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC41.27■■■■■ 4.2
WDR62O43379 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC41.27■■■■■ 4.2
WDR62O43379 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC41.27■■■■■ 4.2
WDR62O43379 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC41.26■■■■■ 4.2
WDR62O43379 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.26■■■■■ 4.2
WDR62O43379 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.26■■■■■ 4.19
WDR62O43379 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC41.25■■■■■ 4.19
WDR62O43379 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC41.24■■■■■ 4.19
WDR62O43379 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC41.24■■■■■ 4.19
WDR62O43379 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC41.23■■■■■ 4.19
WDR62O43379 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC41.23■■■■■ 4.19
WDR62O43379 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC41.23■■■■■ 4.19
WDR62O43379 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC41.23■■■■■ 4.19
WDR62O43379 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC41.23■■■■■ 4.19
WDR62O43379 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC41.22■■■■■ 4.19
WDR62O43379 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.21■■■■■ 4.19
WDR62O43379 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC41.21■■■■■ 4.19
WDR62O43379 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC41.21■■■■■ 4.19
WDR62O43379 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC41.21■■■■■ 4.19
WDR62O43379 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.2■■■■■ 4.19
WDR62O43379 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC41.2■■■■■ 4.19
WDR62O43379 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC41.2■■■■■ 4.19
WDR62O43379 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC41.2■■■■■ 4.19
WDR62O43379 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC41.2■■■■■ 4.19
WDR62O43379 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.2■■■■■ 4.19
WDR62O43379 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC41.2■■■■■ 4.19
WDR62O43379 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.19■■■■■ 4.18
WDR62O43379 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC41.19■■■■■ 4.18
WDR62O43379 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.19■■■■■ 4.18
WDR62O43379 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC41.19■■■■■ 4.18
WDR62O43379 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC41.18■■■■■ 4.18
WDR62O43379 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC41.18■■■■■ 4.18
WDR62O43379 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC41.18■■■■■ 4.18
WDR62O43379 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC41.18■■■■■ 4.18
WDR62O43379 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC41.18■■■■■ 4.18
WDR62O43379 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC41.18■■■■■ 4.18
WDR62O43379 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC41.17■■■■■ 4.18
WDR62O43379 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC41.17■■■■■ 4.18
WDR62O43379 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.17■■■■■ 4.18
WDR62O43379 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC41.16■■■■■ 4.18
WDR62O43379 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC41.16■■■■■ 4.18
WDR62O43379 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.16■■■■■ 4.18
WDR62O43379 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC41.16■■■■■ 4.18
WDR62O43379 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.16■■■■■ 4.18
WDR62O43379 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC41.14■■■■■ 4.18
WDR62O43379 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.14■■■■■ 4.18
WDR62O43379 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.14■■■■■ 4.18
WDR62O43379 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.14■■■■■ 4.18
WDR62O43379 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC41.13■■■■■ 4.17
WDR62O43379 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC41.13■■■■■ 4.17
WDR62O43379 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.13■■■■■ 4.17
WDR62O43379 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.13■■■■■ 4.17
WDR62O43379 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC41.13■■■■■ 4.17
WDR62O43379 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.12■■■■■ 4.17
WDR62O43379 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.12■■■■■ 4.17
WDR62O43379 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC41.12■■■■■ 4.17
WDR62O43379 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC41.11■■■■■ 4.17
WDR62O43379 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC41.11■■■■■ 4.17
WDR62O43379 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC41.11■■■■■ 4.17
WDR62O43379 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC41.11■■■■■ 4.17
WDR62O43379 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC41.11■■■■■ 4.17
WDR62O43379 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.1■■■■■ 4.17
WDR62O43379 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC41.1■■■■■ 4.17
WDR62O43379 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.1■■■■■ 4.17
WDR62O43379 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC41.09■■■■■ 4.17
WDR62O43379 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.09■■■■■ 4.17
WDR62O43379 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.09■■■■■ 4.17
WDR62O43379 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.08■■■■■ 4.17
WDR62O43379 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC41.08■■■■■ 4.17
WDR62O43379 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC41.07■■■■■ 4.17
WDR62O43379 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC41.07■■■■■ 4.16
WDR62O43379 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC41.07■■■■■ 4.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms