Protein–RNA interactions for Protein: O43237

DYNC1LI2, Cytoplasmic dynein 1 light intermediate chain 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DYNC1LI2O43237 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
DYNC1LI2O43237 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
DYNC1LI2O43237 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
DYNC1LI2O43237 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
DYNC1LI2O43237 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
DYNC1LI2O43237 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC26.95■■□□□ 1.9
DYNC1LI2O43237 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
DYNC1LI2O43237 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
DYNC1LI2O43237 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
DYNC1LI2O43237 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.94■■□□□ 1.9
DYNC1LI2O43237 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.94■■□□□ 1.9
DYNC1LI2O43237 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
DYNC1LI2O43237 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
DYNC1LI2O43237 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC26.94■■□□□ 1.9
DYNC1LI2O43237 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
DYNC1LI2O43237 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
DYNC1LI2O43237 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
DYNC1LI2O43237 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
DYNC1LI2O43237 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
DYNC1LI2O43237 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
DYNC1LI2O43237 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
DYNC1LI2O43237 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
DYNC1LI2O43237 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
DYNC1LI2O43237 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
DYNC1LI2O43237 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
DYNC1LI2O43237 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
DYNC1LI2O43237 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
DYNC1LI2O43237 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
DYNC1LI2O43237 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
DYNC1LI2O43237 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
DYNC1LI2O43237 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
DYNC1LI2O43237 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
DYNC1LI2O43237 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
DYNC1LI2O43237 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
DYNC1LI2O43237 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
DYNC1LI2O43237 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
DYNC1LI2O43237 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
DYNC1LI2O43237 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
DYNC1LI2O43237 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
DYNC1LI2O43237 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
DYNC1LI2O43237 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
DYNC1LI2O43237 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
DYNC1LI2O43237 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
DYNC1LI2O43237 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
DYNC1LI2O43237 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
DYNC1LI2O43237 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
DYNC1LI2O43237 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
DYNC1LI2O43237 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC26.87■■□□□ 1.89
DYNC1LI2O43237 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
DYNC1LI2O43237 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
DYNC1LI2O43237 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
DYNC1LI2O43237 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
DYNC1LI2O43237 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
DYNC1LI2O43237 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
DYNC1LI2O43237 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC26.85■■□□□ 1.89
DYNC1LI2O43237 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
DYNC1LI2O43237 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
DYNC1LI2O43237 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
DYNC1LI2O43237 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
DYNC1LI2O43237 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
DYNC1LI2O43237 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
DYNC1LI2O43237 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
DYNC1LI2O43237 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
DYNC1LI2O43237 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
DYNC1LI2O43237 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
DYNC1LI2O43237 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
DYNC1LI2O43237 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
DYNC1LI2O43237 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
DYNC1LI2O43237 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
DYNC1LI2O43237 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
DYNC1LI2O43237 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
DYNC1LI2O43237 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
DYNC1LI2O43237 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
DYNC1LI2O43237 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
DYNC1LI2O43237 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
DYNC1LI2O43237 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
DYNC1LI2O43237 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
DYNC1LI2O43237 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
DYNC1LI2O43237 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
DYNC1LI2O43237 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
DYNC1LI2O43237 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
DYNC1LI2O43237 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
DYNC1LI2O43237 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
DYNC1LI2O43237 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
DYNC1LI2O43237 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
DYNC1LI2O43237 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
DYNC1LI2O43237 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
DYNC1LI2O43237 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
DYNC1LI2O43237 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
DYNC1LI2O43237 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
DYNC1LI2O43237 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
DYNC1LI2O43237 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
DYNC1LI2O43237 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
DYNC1LI2O43237 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
DYNC1LI2O43237 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
DYNC1LI2O43237 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
DYNC1LI2O43237 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
DYNC1LI2O43237 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
DYNC1LI2O43237 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC26.78■■□□□ 1.88
DYNC1LI2O43237 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms