Protein–RNA interactions for Protein: O43164

PJA2, E3 ubiquitin-protein ligase Praja-2, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PJA2O43164 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PJA2O43164 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PJA2O43164 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PJA2O43164 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PJA2O43164 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PJA2O43164 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PJA2O43164 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PJA2O43164 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PJA2O43164 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PJA2O43164 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PJA2O43164 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PJA2O43164 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PJA2O43164 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PJA2O43164 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PJA2O43164 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.65
PJA2O43164 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PJA2O43164 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PJA2O43164 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PJA2O43164 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PJA2O43164 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PJA2O43164 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PJA2O43164 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PJA2O43164 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PJA2O43164 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PJA2O43164 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PJA2O43164 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PJA2O43164 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PJA2O43164 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
PJA2O43164 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PJA2O43164 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PJA2O43164 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PJA2O43164 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PJA2O43164 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PJA2O43164 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PJA2O43164 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PJA2O43164 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
PJA2O43164 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PJA2O43164 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PJA2O43164 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
PJA2O43164 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PJA2O43164 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PJA2O43164 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PJA2O43164 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PJA2O43164 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PJA2O43164 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PJA2O43164 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PJA2O43164 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PJA2O43164 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PJA2O43164 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PJA2O43164 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PJA2O43164 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PJA2O43164 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PJA2O43164 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PJA2O43164 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PJA2O43164 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PJA2O43164 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
PJA2O43164 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PJA2O43164 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PJA2O43164 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PJA2O43164 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PJA2O43164 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PJA2O43164 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PJA2O43164 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PJA2O43164 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PJA2O43164 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PJA2O43164 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PJA2O43164 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PJA2O43164 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PJA2O43164 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PJA2O43164 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PJA2O43164 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PJA2O43164 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PJA2O43164 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PJA2O43164 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PJA2O43164 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PJA2O43164 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PJA2O43164 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PJA2O43164 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PJA2O43164 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
PJA2O43164 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PJA2O43164 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PJA2O43164 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PJA2O43164 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PJA2O43164 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PJA2O43164 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
PJA2O43164 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PJA2O43164 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PJA2O43164 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PJA2O43164 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PJA2O43164 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PJA2O43164 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PJA2O43164 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PJA2O43164 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PJA2O43164 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PJA2O43164 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PJA2O43164 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PJA2O43164 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PJA2O43164 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PJA2O43164 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PJA2O43164 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.3 ms