Protein–RNA interactions for Protein: O15522

NKX2-8, Homeobox protein Nkx-2.8, humanhuman

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX2-8O15522 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NKX2-8O15522 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NKX2-8O15522 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NKX2-8O15522 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NKX2-8O15522 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NKX2-8O15522 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NKX2-8O15522 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NKX2-8O15522 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NKX2-8O15522 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
NKX2-8O15522 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NKX2-8O15522 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NKX2-8O15522 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NKX2-8O15522 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NKX2-8O15522 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NKX2-8O15522 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NKX2-8O15522 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NKX2-8O15522 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NKX2-8O15522 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NKX2-8O15522 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NKX2-8O15522 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NKX2-8O15522 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NKX2-8O15522 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NKX2-8O15522 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NKX2-8O15522 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NKX2-8O15522 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NKX2-8O15522 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NKX2-8O15522 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NKX2-8O15522 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NKX2-8O15522 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NKX2-8O15522 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NKX2-8O15522 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NKX2-8O15522 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NKX2-8O15522 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NKX2-8O15522 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NKX2-8O15522 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NKX2-8O15522 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NKX2-8O15522 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
NKX2-8O15522 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NKX2-8O15522 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NKX2-8O15522 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NKX2-8O15522 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NKX2-8O15522 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
NKX2-8O15522 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
NKX2-8O15522 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NKX2-8O15522 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NKX2-8O15522 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
NKX2-8O15522 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NKX2-8O15522 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NKX2-8O15522 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NKX2-8O15522 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NKX2-8O15522 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NKX2-8O15522 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NKX2-8O15522 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NKX2-8O15522 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NKX2-8O15522 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NKX2-8O15522 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NKX2-8O15522 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NKX2-8O15522 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NKX2-8O15522 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NKX2-8O15522 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NKX2-8O15522 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NKX2-8O15522 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NKX2-8O15522 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NKX2-8O15522 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
NKX2-8O15522 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
NKX2-8O15522 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NKX2-8O15522 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NKX2-8O15522 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NKX2-8O15522 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NKX2-8O15522 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NKX2-8O15522 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NKX2-8O15522 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NKX2-8O15522 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NKX2-8O15522 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NKX2-8O15522 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NKX2-8O15522 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NKX2-8O15522 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NKX2-8O15522 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NKX2-8O15522 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NKX2-8O15522 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NKX2-8O15522 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NKX2-8O15522 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NKX2-8O15522 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NKX2-8O15522 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
NKX2-8O15522 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
NKX2-8O15522 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NKX2-8O15522 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NKX2-8O15522 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NKX2-8O15522 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NKX2-8O15522 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NKX2-8O15522 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NKX2-8O15522 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NKX2-8O15522 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NKX2-8O15522 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NKX2-8O15522 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NKX2-8O15522 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NKX2-8O15522 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NKX2-8O15522 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NKX2-8O15522 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NKX2-8O15522 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.8 ms