Protein–RNA interactions for Protein: O15446

CD3EAP, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA34, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 510 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD3EAPO15446 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CD3EAPO15446 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CD3EAPO15446 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CD3EAPO15446 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CD3EAPO15446 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CD3EAPO15446 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
CD3EAPO15446 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CD3EAPO15446 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CD3EAPO15446 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CD3EAPO15446 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CD3EAPO15446 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CD3EAPO15446 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CD3EAPO15446 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CD3EAPO15446 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CD3EAPO15446 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CD3EAPO15446 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CD3EAPO15446 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CD3EAPO15446 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CD3EAPO15446 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CD3EAPO15446 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
CD3EAPO15446 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
CD3EAPO15446 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CD3EAPO15446 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CD3EAPO15446 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CD3EAPO15446 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CD3EAPO15446 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CD3EAPO15446 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CD3EAPO15446 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CD3EAPO15446 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CD3EAPO15446 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CD3EAPO15446 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CD3EAPO15446 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CD3EAPO15446 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CD3EAPO15446 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CD3EAPO15446 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CD3EAPO15446 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
CD3EAPO15446 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CD3EAPO15446 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CD3EAPO15446 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CD3EAPO15446 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CD3EAPO15446 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CD3EAPO15446 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CD3EAPO15446 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CD3EAPO15446 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CD3EAPO15446 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CD3EAPO15446 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
CD3EAPO15446 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CD3EAPO15446 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CD3EAPO15446 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CD3EAPO15446 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CD3EAPO15446 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CD3EAPO15446 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CD3EAPO15446 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CD3EAPO15446 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CD3EAPO15446 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CD3EAPO15446 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CD3EAPO15446 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CD3EAPO15446 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CD3EAPO15446 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CD3EAPO15446 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CD3EAPO15446 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CD3EAPO15446 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CD3EAPO15446 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CD3EAPO15446 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
CD3EAPO15446 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CD3EAPO15446 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CD3EAPO15446 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CD3EAPO15446 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CD3EAPO15446 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CD3EAPO15446 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CD3EAPO15446 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CD3EAPO15446 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CD3EAPO15446 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CD3EAPO15446 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CD3EAPO15446 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CD3EAPO15446 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CD3EAPO15446 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CD3EAPO15446 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CD3EAPO15446 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CD3EAPO15446 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
CD3EAPO15446 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CD3EAPO15446 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CD3EAPO15446 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CD3EAPO15446 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CD3EAPO15446 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CD3EAPO15446 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CD3EAPO15446 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CD3EAPO15446 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CD3EAPO15446 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CD3EAPO15446 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CD3EAPO15446 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CD3EAPO15446 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CD3EAPO15446 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CD3EAPO15446 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CD3EAPO15446 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CD3EAPO15446 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CD3EAPO15446 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CD3EAPO15446 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CD3EAPO15446 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CD3EAPO15446 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms