Protein–RNA interactions for Protein: O15078

CEP290, Centrosomal protein of 290 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 2,479 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP290O15078 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CEP290O15078 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CEP290O15078 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CEP290O15078 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CEP290O15078 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CEP290O15078 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CEP290O15078 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CEP290O15078 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CEP290O15078 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CEP290O15078 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CEP290O15078 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CEP290O15078 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CEP290O15078 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CEP290O15078 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
CEP290O15078 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CEP290O15078 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CEP290O15078 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CEP290O15078 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CEP290O15078 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CEP290O15078 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CEP290O15078 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CEP290O15078 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CEP290O15078 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CEP290O15078 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
CEP290O15078 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CEP290O15078 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CEP290O15078 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CEP290O15078 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CEP290O15078 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CEP290O15078 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CEP290O15078 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CEP290O15078 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CEP290O15078 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CEP290O15078 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.84
CEP290O15078 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.84
CEP290O15078 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.84
CEP290O15078 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.84
CEP290O15078 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CEP290O15078 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CEP290O15078 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CEP290O15078 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CEP290O15078 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CEP290O15078 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CEP290O15078 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
CEP290O15078 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CEP290O15078 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CEP290O15078 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CEP290O15078 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CEP290O15078 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CEP290O15078 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CEP290O15078 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
CEP290O15078 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CEP290O15078 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CEP290O15078 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CEP290O15078 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
CEP290O15078 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CEP290O15078 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CEP290O15078 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
CEP290O15078 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CEP290O15078 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CEP290O15078 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CEP290O15078 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CEP290O15078 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CEP290O15078 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
CEP290O15078 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CEP290O15078 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
CEP290O15078 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC26.45■■□□□ 1.83
CEP290O15078 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
CEP290O15078 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC26.45■■□□□ 1.83
CEP290O15078 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CEP290O15078 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CEP290O15078 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CEP290O15078 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CEP290O15078 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CEP290O15078 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CEP290O15078 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CEP290O15078 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CEP290O15078 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CEP290O15078 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CEP290O15078 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CEP290O15078 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CEP290O15078 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CEP290O15078 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CEP290O15078 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CEP290O15078 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
CEP290O15078 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CEP290O15078 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CEP290O15078 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CEP290O15078 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CEP290O15078 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CEP290O15078 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CEP290O15078 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CEP290O15078 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CEP290O15078 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CEP290O15078 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CEP290O15078 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CEP290O15078 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CEP290O15078 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CEP290O15078 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CEP290O15078 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
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