Protein–RNA interactions for Protein: O15020

SPTBN2, Spectrin beta chain, non-erythrocytic 2, humanhuman

Predictions only

Length 2,390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTBN2O15020 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
SPTBN2O15020 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SPTBN2O15020 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SPTBN2O15020 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SPTBN2O15020 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SPTBN2O15020 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SPTBN2O15020 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SPTBN2O15020 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SPTBN2O15020 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SPTBN2O15020 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SPTBN2O15020 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SPTBN2O15020 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
SPTBN2O15020 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SPTBN2O15020 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SPTBN2O15020 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SPTBN2O15020 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SPTBN2O15020 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SPTBN2O15020 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SPTBN2O15020 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
SPTBN2O15020 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
SPTBN2O15020 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SPTBN2O15020 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SPTBN2O15020 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SPTBN2O15020 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SPTBN2O15020 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SPTBN2O15020 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SPTBN2O15020 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SPTBN2O15020 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SPTBN2O15020 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SPTBN2O15020 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SPTBN2O15020 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SPTBN2O15020 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SPTBN2O15020 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SPTBN2O15020 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SPTBN2O15020 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SPTBN2O15020 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SPTBN2O15020 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SPTBN2O15020 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SPTBN2O15020 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SPTBN2O15020 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SPTBN2O15020 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SPTBN2O15020 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SPTBN2O15020 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SPTBN2O15020 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SPTBN2O15020 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SPTBN2O15020 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SPTBN2O15020 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SPTBN2O15020 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SPTBN2O15020 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SPTBN2O15020 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SPTBN2O15020 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SPTBN2O15020 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
SPTBN2O15020 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
SPTBN2O15020 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SPTBN2O15020 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SPTBN2O15020 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
SPTBN2O15020 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SPTBN2O15020 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SPTBN2O15020 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
SPTBN2O15020 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SPTBN2O15020 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SPTBN2O15020 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SPTBN2O15020 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SPTBN2O15020 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SPTBN2O15020 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SPTBN2O15020 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SPTBN2O15020 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
SPTBN2O15020 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SPTBN2O15020 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SPTBN2O15020 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
SPTBN2O15020 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SPTBN2O15020 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SPTBN2O15020 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SPTBN2O15020 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SPTBN2O15020 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
SPTBN2O15020 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SPTBN2O15020 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SPTBN2O15020 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SPTBN2O15020 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SPTBN2O15020 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SPTBN2O15020 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SPTBN2O15020 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SPTBN2O15020 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SPTBN2O15020 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SPTBN2O15020 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SPTBN2O15020 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SPTBN2O15020 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SPTBN2O15020 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SPTBN2O15020 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SPTBN2O15020 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SPTBN2O15020 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SPTBN2O15020 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SPTBN2O15020 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
SPTBN2O15020 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SPTBN2O15020 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SPTBN2O15020 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SPTBN2O15020 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SPTBN2O15020 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SPTBN2O15020 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SPTBN2O15020 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.6 ms