Protein–RNA interactions for Protein: O00574

CXCR6, C-X-C chemokine receptor type 6, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCR6O00574 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CXCR6O00574 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CXCR6O00574 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CXCR6O00574 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CXCR6O00574 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CXCR6O00574 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CXCR6O00574 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CXCR6O00574 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CXCR6O00574 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CXCR6O00574 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CXCR6O00574 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CXCR6O00574 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CXCR6O00574 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CXCR6O00574 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CXCR6O00574 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CXCR6O00574 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CXCR6O00574 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CXCR6O00574 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CXCR6O00574 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CXCR6O00574 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CXCR6O00574 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CXCR6O00574 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CXCR6O00574 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CXCR6O00574 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CXCR6O00574 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CXCR6O00574 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CXCR6O00574 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CXCR6O00574 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CXCR6O00574 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CXCR6O00574 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CXCR6O00574 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CXCR6O00574 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CXCR6O00574 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CXCR6O00574 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CXCR6O00574 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CXCR6O00574 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CXCR6O00574 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CXCR6O00574 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CXCR6O00574 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CXCR6O00574 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CXCR6O00574 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CXCR6O00574 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CXCR6O00574 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CXCR6O00574 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CXCR6O00574 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CXCR6O00574 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CXCR6O00574 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CXCR6O00574 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CXCR6O00574 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CXCR6O00574 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CXCR6O00574 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CXCR6O00574 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CXCR6O00574 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CXCR6O00574 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CXCR6O00574 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CXCR6O00574 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CXCR6O00574 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CXCR6O00574 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CXCR6O00574 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CXCR6O00574 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CXCR6O00574 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CXCR6O00574 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CXCR6O00574 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CXCR6O00574 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CXCR6O00574 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CXCR6O00574 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CXCR6O00574 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CXCR6O00574 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CXCR6O00574 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CXCR6O00574 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CXCR6O00574 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CXCR6O00574 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CXCR6O00574 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CXCR6O00574 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CXCR6O00574 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CXCR6O00574 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CXCR6O00574 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CXCR6O00574 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CXCR6O00574 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CXCR6O00574 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CXCR6O00574 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CXCR6O00574 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CXCR6O00574 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CXCR6O00574 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CXCR6O00574 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CXCR6O00574 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CXCR6O00574 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CXCR6O00574 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CXCR6O00574 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CXCR6O00574 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CXCR6O00574 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CXCR6O00574 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CXCR6O00574 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CXCR6O00574 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CXCR6O00574 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CXCR6O00574 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CXCR6O00574 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CXCR6O00574 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CXCR6O00574 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CXCR6O00574 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms