Protein–RNA interactions for Protein: O00470

MEIS1, Homeobox protein Meis1, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEIS1O00470 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
MEIS1O00470 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
MEIS1O00470 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
MEIS1O00470 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
MEIS1O00470 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
MEIS1O00470 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
MEIS1O00470 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
MEIS1O00470 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
MEIS1O00470 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
MEIS1O00470 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
MEIS1O00470 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
MEIS1O00470 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
MEIS1O00470 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
MEIS1O00470 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
MEIS1O00470 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
MEIS1O00470 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
MEIS1O00470 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
MEIS1O00470 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
MEIS1O00470 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
MEIS1O00470 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
MEIS1O00470 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
MEIS1O00470 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
MEIS1O00470 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
MEIS1O00470 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
MEIS1O00470 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
MEIS1O00470 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
MEIS1O00470 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
MEIS1O00470 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
MEIS1O00470 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
MEIS1O00470 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
MEIS1O00470 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
MEIS1O00470 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
MEIS1O00470 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
MEIS1O00470 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
MEIS1O00470 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
MEIS1O00470 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
MEIS1O00470 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
MEIS1O00470 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
MEIS1O00470 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
MEIS1O00470 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
MEIS1O00470 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
MEIS1O00470 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
MEIS1O00470 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
MEIS1O00470 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
MEIS1O00470 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
MEIS1O00470 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
MEIS1O00470 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
MEIS1O00470 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
MEIS1O00470 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
MEIS1O00470 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
MEIS1O00470 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
MEIS1O00470 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
MEIS1O00470 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
MEIS1O00470 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
MEIS1O00470 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
MEIS1O00470 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
MEIS1O00470 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
MEIS1O00470 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
MEIS1O00470 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
MEIS1O00470 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
MEIS1O00470 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
MEIS1O00470 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
MEIS1O00470 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
MEIS1O00470 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
MEIS1O00470 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
MEIS1O00470 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
MEIS1O00470 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
MEIS1O00470 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
MEIS1O00470 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC27.03■■□□□ 1.92
MEIS1O00470 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC27.03■■□□□ 1.92
MEIS1O00470 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
MEIS1O00470 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
MEIS1O00470 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
MEIS1O00470 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
MEIS1O00470 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
MEIS1O00470 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
MEIS1O00470 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
MEIS1O00470 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
MEIS1O00470 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
MEIS1O00470 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
MEIS1O00470 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
MEIS1O00470 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
MEIS1O00470 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
MEIS1O00470 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
MEIS1O00470 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC27■■□□□ 1.91
MEIS1O00470 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
MEIS1O00470 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
MEIS1O00470 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
MEIS1O00470 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
MEIS1O00470 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
MEIS1O00470 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
MEIS1O00470 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
MEIS1O00470 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
MEIS1O00470 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
MEIS1O00470 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
MEIS1O00470 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
MEIS1O00470 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
MEIS1O00470 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
MEIS1O00470 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
MEIS1O00470 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms